论文部分内容阅读
目的:
通过比较破裂颅内动脉瘤(Ruptured IAs,RIAs)和未破裂颅内动脉瘤(Unruptured IAs, UIAs)患者外周血血浆蛋白质组学的差异,寻找颅内动脉瘤破裂可能相关的生物学标志物。
方法:
分别收集5例破裂和5例未破颅内动脉瘤患者的外周血血浆,通过使用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,ITRAQ)技术对样本进行蛋白组学测序,得到差异表达蛋白(different expressed proteins, DEPs),通过生物信息学方法对其生物学过程、分子功能、细胞组分富集分别做GeneOntology(GO)功能富集分析以及蛋白质互作分析。最后,利用酶联免疫检测技术(ELISA),对两个表达具有显著性差异的代表性蛋白质,C反应蛋白(C-reactive protein, CRP),胶原蛋白α-2链(I)(Collagen alpha-2 chain (I),COL1A2)扩大样本进行验证。
结果:
蛋白组学测序一共得到1261种蛋白质,选取差异表达倍数在1.5倍以上,且P<0.05的蛋白质共8个,其中上调蛋白质一共有3个,包括维生素k依赖蛋白Z(VitaminK-dependentproteinZ、间α胰蛋白酶抑制剂重链H3(Inter-alpha-trypsininhibitorheavychainH3)和CRP,下调蛋白一共有5个,包括胶原α-2(I)链(Collagen alpha-2(I)chain, COL1A2)、胶原α-1(I)链(Collagen alpha-1(I)chain, COL1A1)、a-激酶锚定蛋白3(A-kinase anchor protein 3)、钠依赖性磷酸转运体2(Sodium-dependent phosphate transporter 2)和核孔膜糖蛋白210(Nuclear pore membrane glycoprotein 210);其中上调最显著的是CRP,为2.84倍;下调最显著的是COL1A2,为0.2倍。通过生物信息学分析,显示这些DEPs主要参与急性期反应(acute-phase response)、蛋白质异源三聚化(protein heterotrimerization)和血管生长(blood vessel development)等过程。大样本的ELISA验证结果显示,与UIAs比较,RIAs血浆中的C反应蛋白表达均呈上调趋势且具有统计学意义(P<0.05);胶原蛋白α原(I)链的表达水平显著下调且具有统计学意义(P<0.01)。将ELISA结果与质谱分析结果对比分析,发现C反应蛋白和胶原蛋白α原(I)链表达结果与ITRAQ技术分析得到的结果一致。
结论:
与UIAs患者相比,RIAs患者外周血血浆中的蛋白组学存在一定的差异性;CRP与COL1A2可能是RIAs破裂的潜在的外周血生物标志物。
通过比较破裂颅内动脉瘤(Ruptured IAs,RIAs)和未破裂颅内动脉瘤(Unruptured IAs, UIAs)患者外周血血浆蛋白质组学的差异,寻找颅内动脉瘤破裂可能相关的生物学标志物。
方法:
分别收集5例破裂和5例未破颅内动脉瘤患者的外周血血浆,通过使用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,ITRAQ)技术对样本进行蛋白组学测序,得到差异表达蛋白(different expressed proteins, DEPs),通过生物信息学方法对其生物学过程、分子功能、细胞组分富集分别做GeneOntology(GO)功能富集分析以及蛋白质互作分析。最后,利用酶联免疫检测技术(ELISA),对两个表达具有显著性差异的代表性蛋白质,C反应蛋白(C-reactive protein, CRP),胶原蛋白α-2链(I)(Collagen alpha-2 chain (I),COL1A2)扩大样本进行验证。
结果:
蛋白组学测序一共得到1261种蛋白质,选取差异表达倍数在1.5倍以上,且P<0.05的蛋白质共8个,其中上调蛋白质一共有3个,包括维生素k依赖蛋白Z(VitaminK-dependentproteinZ、间α胰蛋白酶抑制剂重链H3(Inter-alpha-trypsininhibitorheavychainH3)和CRP,下调蛋白一共有5个,包括胶原α-2(I)链(Collagen alpha-2(I)chain, COL1A2)、胶原α-1(I)链(Collagen alpha-1(I)chain, COL1A1)、a-激酶锚定蛋白3(A-kinase anchor protein 3)、钠依赖性磷酸转运体2(Sodium-dependent phosphate transporter 2)和核孔膜糖蛋白210(Nuclear pore membrane glycoprotein 210);其中上调最显著的是CRP,为2.84倍;下调最显著的是COL1A2,为0.2倍。通过生物信息学分析,显示这些DEPs主要参与急性期反应(acute-phase response)、蛋白质异源三聚化(protein heterotrimerization)和血管生长(blood vessel development)等过程。大样本的ELISA验证结果显示,与UIAs比较,RIAs血浆中的C反应蛋白表达均呈上调趋势且具有统计学意义(P<0.05);胶原蛋白α原(I)链的表达水平显著下调且具有统计学意义(P<0.01)。将ELISA结果与质谱分析结果对比分析,发现C反应蛋白和胶原蛋白α原(I)链表达结果与ITRAQ技术分析得到的结果一致。
结论:
与UIAs患者相比,RIAs患者外周血血浆中的蛋白组学存在一定的差异性;CRP与COL1A2可能是RIAs破裂的潜在的外周血生物标志物。