SEPT9基因多态性与结直肠癌预后的关联研究

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背景此前多篇文献报道SEPT9被用于筛查结直肠癌(CRC),但其在预测结直肠癌预后中的重要潜力却经常被忽略。我们拟从遗传变异的角度研究SEPT9基因与结直肠癌患者的预后生存的相关性。方法344名结直肠癌患者被纳入研究去验证SEPT9基因中的303个常见单核苷酸多态性(SNPs)与总生存期(OS)的关联。运用连锁不平衡(LD)分析,以筛选出具有代表性的SNPs,并通过功能预测确定了这些SNPs对于相对应基因和结直肠癌可能产生的影响。使用错误发现率(FDR)对结果进行了多次比较的校正。通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库进一步验证了结直肠癌与SEPT9基因甲基化之间的关系。结果我们确定SEPT9 rs4788984(T>C)突变可以作为结直肠癌总体生存率(OS)的一个预测因子。基因型为C等位基因的结直肠癌患者比基因型为T等位基因的患者有着更差的生存时间(危险比(HR)=1.36,95%CI=1.07-1.71,1.00×10-2,FDR=0.035)。此外,TCGA的数据显示,结直肠癌组织与正常组织之间SEPT9的甲基化水平存在显着差异(P=6.67×10-17)。结论SEPT9 rs4788984(T>C)与结直肠癌的预后有着较强的相关性。但仍需要进一步的机制研究以验证我们的发现。
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