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本试验以中国荷斯坦牛和黄改奶牛为研究对象,采用PCR-SSCP分子标记方法对CSN1S2基因的多态性进行了分析,并结合测序对其基因的5’端、第2外显子和第3、4、5外显子进行了序列分析,旨在探索CSN1S2基因对奶牛生产性状的影响,为今后高良种奶牛的选育提供一定的理论依据。研究结果如下:1. CSN1S2基因5’端多态性及序列分析在中国荷斯坦牛和黄改奶牛5’端的引物CSN1S2P1扩增片段均检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC 6种基因型,群体多态信息含量(PIC)达到了中度多态(0.5 >PIC >0.25),群体中多态性高,遗传变异较大。测序结果显示,AA基因型个体在第2370bp处发生了G到A的碱基突变;BB基因型变异位点最多:在第2187bp处T碱基突变为G碱基,第2423bp处T碱基突变为C碱基,第2505bp处C碱基突变为A碱基,第2532bp、2533bp处C和T碱基突变为T和G碱基;CC基因型个体在2370bp处G碱基突变为A碱基,第2405bp处C碱基突变为A碱基,第2525bp处插入一个G碱基。2. CSN1S2基因第2外显子多态性及序列分析在中国荷斯坦牛和黄改奶牛第2外显子的引物CSN1S2P2扩增片段检测到AA、BB、AB 3种基因型。具有多态性DNA序列在CSN1S2基因第二外显子所扩增的片段中AA基因型和BB基因型中国荷斯坦牛和黄改奶牛个体均在第4129bp处发生了碱基突变,T碱基突变成了G碱基,BB基因型个体在第4263bp处插入了一个G碱基,第4346bp处碱基T突变成了碱基C;BB基因型个体在第4263bp处的突变位于编码区,发生的突变是同义突变,未造成氨基酸的变化。3. CSN1S2基因第4、5外显子多态性及序列分析第4、5外显子的引物CSN1S2 P3扩增片段在中国荷斯坦牛检测到AA、BB、AB三种基因型,在黄改奶牛上只检测到AA和AB两种基因型,没有检测到BB基因型。在CSN1S2基因引物CSN1S2 P3所扩增的片段中AA基因型个体在第6892bp处T碱基突变成为C碱基, 6920bp处A碱基突变为G碱基,7174bp处插入一个C碱基;BB基因型仅在第6920bp处A碱基突变为G碱基。4. CSN1S2基因第3外显子多态性第3外显子的引物CSN1S2 P4扩增片段在中国荷斯坦牛中表现出多态性,但是只检测出一个BB基因型个体,其余全部是AA基因型个体,没有检测出AB基因型个体;在黄改奶牛中只检测出AA基因型个体,没有检测出AB基因型和BB基因型个体。5. CSN1S2基因多态性与产奶性状之间的关系本试验将CSN1S2基因作为中国荷斯坦牛和黄改奶牛产奶性状的候选基因进行研究,研究发现在CSN1S2P1扩增片段中,中国荷斯坦牛BC基因型个体产奶量表现最好;在CSN1S2P2扩增片段中,中国荷斯坦牛AA基因型个体的乳蛋白率表现最好,适合作为中国荷斯坦牛的标记辅助选择位点。在CSN1S2P2扩增片段中黄改奶牛AA基因型个体的乳脂率和乳蛋白率显著高于BB和AB基因型个体,AA基因型个体产奶量也高于其他两种基因型,适合作为黄改奶牛的标记辅助选择位点。