论文部分内容阅读
黄腹角雉在我国的分布范围比较狭窄,而且种群数量也急剧下降,为我国Ⅰ级保护鸟类,而通过获得主要组织相容性复合体这一基因的遗传多态性来揭示物种的遗传背景,可为制定保护策略提供依据。目前为止还未曾见过黄腹角雉MHC BLB exon2基因多态性和雉科中白鹇、白冠长尾雉、白腹锦鸡、红腹角雉、白颈长尾雉的BLB exon1-exon4基因的研究报道,而这些物种的MHC基因对于抗病性和繁殖力都有很大的相关性。 本研究通过实验获得黄腹角雉10个个体的BLB基因的exon2序列和雉科6种鸟类的BLB基因exon1-exon4序列,并利用生物学软件对所获得的核苷酸序列进行分析,从而为进一步研究鸟类MHC基因家族的功能奠定基础,为物种保护和抗病育种提供理论依据,分析结果如下: 1.从10个黄腹角雉个体中得到14个等位基因序列。平均非同义替换率dN=0.1593;平均同义替换率dS=0.1448; dN/dS=1.100。黄腹角雉的BLB exon2基因受到了正选择作用,无负选择作用。雉科鸟类中白鹇、白腹锦鸡、红腹角雉和白冠长尾雉β1的dN/dS值均大于1,受正选择作用。 2.黄腹角雉14个等位基因的核苷酸多样度(Pi)值为0.139小于0.25,与以往的研究和取值范围对比,表明该种群的遗传多样性偏低,暗示该物种对疾病的抵抗能力较弱。 3.根据黄腹角雉个体BLB基因分型、进化树和亲缘关系网络图显示,黄腹角雉可能至少存在3个BLB基因位点。 4.从6种雉科鸟类的11个个体的86个有效BLB exon1-4序列中共定义了22个单倍型,获得的编码区全长为629bp,包含4个外显子和3个内含子。 5.根据雉科6种鸟类的22个单倍型exon2构建的系统树中表明是以位点特异性的形式进化,以intron2构建的系统树表现出了以物种特异性的形式进化。 6.以exon2构建的鸡形目19种鸟类的系统发育树和以雉科11种鸟类的BLB exon2-4构建系统发育树均显示出BLB基因的跨物种进化现象。