自南明覆灭,云南纳入清朝版图,康熙朝便开始了对云南社会的治理。因吴三桂坐镇滇中,时间未几,又起兵反清,使得云南社会疮痍遍布,惨不忍睹。康熙朝接手云南于乱世,为重建云南的社会秩序,从政治、军事、经济、文教等领域对云南社会秩序进行了重建性治理。从政治角度,康熙朝继承顺治朝的行政制度,对云南采取了实质性的行政初设,以后各朝在此基础之上又作了诸多调整和改革,并重新规定了云南的户口编审制度和田赋数额。在经济领域,康熙朝注重云南农业的发展,兼顾对矿业、商业的管理,虽然康熙时期云南的赋役很重,但频繁的蠲赋行为仍然使百姓得到了休养生息。振兴文教是康熙朝治理云南社会举措中一个很有特色的内容,通过振兴文教来重建云南紊乱的社会秩序,取得了良好效果。康熙朝还酌定营制,全滇布防,加强对云南社会的军事弹压,在战乱初定时对云南社会的稳定起到了重要作用。雍正朝承袭康熙朝的社会治理政策并有所发展,开始对云南社会拓力改革。首先,雍正朝体恤民生,重视发展云南农业,兴修水利。其次,雍正朝改革云南保甲,推行全省,乾隆朝则愈完善之,此举对后世影响到深远。再次,雍正朝开发云南交通,尤其注重水路交通的开发,在开修滇粤河道时投入了大量精力,虽然未能取得预期效果,但却反映出雍正朝对云南社会治理的力度与决心。雍正朝最为值得一提的是在云南的改土归流,推进了边疆与内地的一体化进程,使云南少数民族地区的社会形态发生巨大变迁。乾隆朝同样承袭雍正朝的社会治理政策并在此基础上更加完善,社会治理领域也更加广泛和深入。乾隆朝为解决云南日益增长的人口压力,继续注重农业发展。因云南自然灾害时有发生,乾隆朝以民生为重,逢灾必赈,效果甚好。乾隆朝还根据云南的特殊情况,改革命、盗等刑名案件的处置规条,并采取各种措施维护社会秩序,减少各种案件的发生。云南界连外域,为保障云南社会免受外敌入侵,乾隆朝遍修城垣,以保疆固圉,减少危害云南社会的不稳定因素。乾隆朝还整饬吏治,但依然难挽云南社会衰落之颓势。康雍乾三朝对云南社会的治理可谓是经历了一个从粗定到完善,从宏观到细微的深入过程,后朝承袭前朝政策并进行发展、改革和完善,最终成就了云南社会的乾隆盛世。但康雍乾三朝对云南社会的治理并非尽美尽善,同样存在着一定局限和缺憾,也正是如此,诸多社会矛盾的积累使清朝进入嘉庆时期便日益走向衰落。