伤寒沙门菌小RNA SbfR相关功能研究

来源 :江苏大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:gaodmljs
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:  小RNA SbfR是本课题组通过Solexa高通量测序技术首次在伤寒沙门菌中发现的一个非编码RNA,相关分子特性分析结果显示,SbfR可能是一反式编码RNA。本论文旨在初步探索SbfR在伤寒沙门菌中发挥的调节作用和机制,为后续研究SbfR靶基因及作用机制奠定基础。  方法:  1. 伤寒沙门菌转录组分析:将 SbfR 缺陷株(ΔSbfR+pBAD)和 SbfR 回补株(ΔSbfR+pBAD-SbfR)培养至对数期(OD600≈0.4),加入L-阿拉伯糖诱导后提取细菌总RNA,加入荧光素进行逆转录,标记后的cDNA与全基因组芯片杂交,扫描并进行数据分析,比较SbfR缺陷株和回补株基因表达谱差异。选择部分差异表达基因进行qRT-PCR,验证基因芯片结果。  2. qRT-PCR分析基因表达:分别提取各菌株总RNA并逆转录为cDNA,进行qRT-PCR实验,检测基因的mRNA水平。  3. 细菌在不同温度下的生长曲线测定:分别在37℃和42℃培养SbfR缺陷株和回补株,每隔1h检测OD600值,以OD600数值作纵坐标,以时间作横坐标,绘制SbfR缺陷株和回补株的生长曲线,比较SbfR对细菌在两种温度下生长情况的影响。  4. SbfR片段分部回补株构建:分别构建连有SbfR前69nt和后69nt片段的重组载体,所用质粒为pBAD/Myc-HisA,并将重组载体电转入ΔSbfR,制备前69nt和后69nt SbfR片段回补株。  5. 细菌动力实验:将空载体株(WT+pBAD)、SbfR 缺陷株、SbfR 回补株及SbfR片段分部回补株分别培养至对数期,用接种针蘸取菌液点种于LB半固体动力板,置于37℃孵箱过夜,测量细菌圈直径,分析SbfR对细菌动力的影响。  6. Western-blot检测FljB表达水平:将空载体株、SbfR缺陷株和SbfR回补株培养至对数期,收集全菌蛋白,用兔抗FljB抗血清进行Western-blot实验,检测各菌株FljB表达水平。  7. HeLa细胞侵袭实验:将空载体株、SbfR缺陷株和SbfR回补株培养至对数期,与HeLa细胞共孵育90min,弃去培养液。一半细胞孔中加入Triton裂解细胞,涂板培养,计数菌落数为粘附水平;一半细胞孔中加入庆大霉素培养 90min后,加入Triton裂解细胞,涂板培养,计数菌落数为侵袭水平。  8. 生物膜形成实验:在 TSB 培养基中分别培养空载体株、SbfR 缺陷株、SbfR回补株及SbfR片段分部回补株至对数期,转种至96孔板,30℃静置4天,洗去浮游细菌并用结晶紫对生物膜染色,30%冰醋酸洗脱后595nm比色测定。  结果:  1. 基因芯片分析结果显示,SbfR 缺陷株与回补株之间共 99 个基因表达水平存在差异;qRT-PCR结果与基因芯片分析数据相比,基因变化趋势一致。  2. 生长曲线测定结果表明,在37℃条件下SbfR缺陷株与回补株的生长情况一致,而在42℃条件下回补株的生长明显慢于缺陷株。  3. 成功构建 SbfR 前 69nt 片段和后 69nt 片段的回补株(ΔSbfR+pBAD-F69,ΔSbfR+pBAD-L69)。  4. 动力实验结果表明,与空载体株相比,SbfR缺陷株动力下降,回补株动力恢复;两部分SbfR片段回补株动力均恢复到空载体株水平,且与SbfR全长回补株动力水平一致。  5. 与空载体株相比,SbfR缺陷株FljB表达水平下降,回补株FljB表达水平恢复。  6. 与空载体株相比,SbfR缺陷株对HeLa细胞的侵袭能力下降,回补株的侵袭能力恢复。  7. 与空载体株相比,SbfR缺陷株的生物膜形成能力下降,回补株的形成能力恢复。两部分SbfR片段回补株生物膜形成能力均部分恢复,与空载体株水平一致,但比SbfR全长回补株弱。  8. SbfR缺陷株hslS、hslT、htpG、fliA、fljB、sopE等基因的转录水平低于SbfR回补株;flhD的转录水平高于SbfR回补株;prgJ、fimA、csgA、yihP、rfaD、bcsA、wcaA、bapA等基因的转录水平与SbfR回补株的差异无统计学意义。  结论:  sRNA SbfR参与伤寒沙门菌热应激条件下生长、动力、侵袭、生物膜形成等方面的调节,抑制热应激条件下细菌生长,促进细菌动力、侵袭和生物膜形成能力。SbfR前69nt和后69nt回补株均可独立完成全长SbfR对细菌动力的促进作用,但在形成生物膜能力方面两种部分回补株分别发挥全长SbfR的部分调控作用。
其他文献
Being categorized into New Gothic sets, Maxine Hong Kinstons The Woman Warrior has lots to do with the strange set-ting. While the concept ofThe uncannyis chara
China has a long history of translation and makes great achievements. Two translators, Zhang Peiji and Liu Shicong have unique style of translation, making prom
目的:本研究拟通过腰身指数(腰围身高比值,WHtR)与冠状动脉造影结果以及冠心病危险因素的探索和分析,以探讨腹型肥胖与冠心病的相关性,并运用比较简明的科学方法,对腹型肥胖症人群