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近些年,大量的生活污水和工业废水造成我国水体严重污染,氮素污染尤为普遍。在污水脱氮的处理中,微生物修复技术应用广泛,而水体中受环境影响的微生物直接决定微生物修复技术的效果。为了更好的对氮污染水体进行调控,本研究分别在2015年4月2016年3月对杭州市九溪、西湖、贴沙河、京杭运河、钱家河水体进行了12次季节性的采样,探究了不同氮污染水体中微生物群落结构与环境因子的相互关系。主要研究结果如下:（1）不同氮污染水体中理化指标存在差异,并随季节发生变化:九溪的NO3--N年均含量最高（3.904 mg/L）,C/N年均最低（1.4）;钱家河的NO2--N、NH4+-N、TN、TP、TOC的含量最高。在不同的季节中,NO3--N、NO2--N、的浓度稳定;九溪、西湖、贴沙河的NH4+-N、TN、TP、TOC、DO的含量随季节的变化基本保持稳定;京杭运河、钱家河的NH4+-N、TN、TP、TOC、DO的含量随季节变化而变化:不同氮污染水体的细菌多样性比较:京杭运河>钱家河>西湖>贴沙河>九溪。（2）五水体四个季节的高通量测序结果:共发现细菌种类归属于40个门,85个纲,187个目,343个科及749个属,除了夏季贴沙河外变形菌门都是最优势类群,所占的比例从31.62%至92.72%不等,夏季含量低,冬季含量高;夏季贴沙河则由蓝藻菌门占优势,其比例为63.43%。反硝化功能细菌种类归属于5个门,8个纲,21个目,29个科及49个属,其中变形菌门都是最优势类群,所占的比例从55.58%至99.96%不等。典型相关性分析（CCA）结果表明,水体中T、TOC、TP、溶氧量的浓度与微生物群落结构的关联度最高,T、C/N对反硝化功能微生物群落影响最大。（3）室内模拟实验与原位培养试验发现:水样的TN、TP、TOC与C/N比在024h变化趋势明显,24h后各含量基本稳定。不同水体的TN、C/N在96h时与原位水含量一致;TOC、总磷含量在96h时比0h趋近于原位水;九溪、西湖、贴沙河水还是保持低氨氮水平。不同水样的胞外酶活在96h内增长趋势越来越明显;不同水样的细菌丰度在96h内迅速增长。研究表明,九溪、西湖、贴沙河水中有活跃的降氨氮的功能细菌。通过DGGE图谱的主要成分分析结果表明,将不同的水体置于模拟原位水和原位水中,均会使水体中的细菌群落结构发生变化。不同水体中的细菌群落在模拟培养或原位水体中变化趋势有差异。