当前我国铁路正处于大力发展的关键时期,铁路的各项改革、发展和运转都需要良好的外部环境支持,而税收政策作为国家调整产业结构的重要手段,更应该给予其足够的倾斜。本文在理论基础的支持下,借鉴国际经验,并采取理论与实践相结合、系统与局部相结合、定性分析与定量分析相结合的方法,对我国铁路运输企业的流转税问题进行了研究。本文对铁路运输企业的流转税的研究主要是从国家对铁路运输企业的流转税政策以及铁路运输企业自身流转税纳税筹划两个方面进行的。在我国现行的税收制度下,铁路运输企业流转税税负重、重复纳税问题突出,企业无法有效地降低运营成本。同时又在国家对铁路运输价格严格管制的情况下,行业很难取得足够的收益以维持铁路改革发展的继续进行。鉴于此,本文按照税收中性理论,分析了铁路运输企业流转税制改革的必要性和可行性,认为消除铁路行业重复纳税的最佳选择是改营业税为增值税。同时,本文结合我国铁路运输企业目前为营业税纳税人的实际情况,为铁路运输企业设计了营业税税收优惠政策方案。如:免征铁路运输企业之间收付费业务营业税、降低铁路运输企业的营业税税率以及免征铁路建设基金营业税。本文在设计国家对铁路运输企业流转税政策的同时,对铁路运输企业如何进行流转税纳税筹划进行了方案设计,主要包括铁路运输企业流转税纳税人身份的筹划、营业税税率及营业额的筹划、固定资产的筹划、企业之间资金占用费的筹划、企业之间相互提供劳务以及转供水电等方面的筹划方案。