随着国家对高等教育的大力支持,近年来我国高校的办学规模不断壮大,招生数量迅速提高,受到高等教育的专业人才也越来越多。但与此同时,高校的业务内容和控制风险也逐步呈现出多样化,近年来高校科研经费、后勤管理、基建项目、自主招生等领域的腐败案件让人触目惊心。2017年2月中央对29所中管高校开展首轮机动巡视,发掘高校问题死角,对高校腐败风气形成了有力的震慑,可见国家层面正在逐渐加强对高校问题的监督检查力度。如何降低高校运行风险、提升管理水平,是高校管理者亟需解决的首要问题,而解决问题尤为关键的就是加强内部控制的建设与运行效果,加强检查力度。制度能否贯彻落实到位,直接影响着高校的良性循环和顺利发展,因此,研究内部控制运行有效性,如何贯彻内部控制制度并将其执行到底,具有非常重要的意义。本文拟从以下六个主要部分展开研究:第一部分是绪论,基于目前研究背景及我国高校管理过程中出现的问题,查阅大量国内外相关文献并归纳整理,为后续研究提供参考。第二部分是理论概述,主要是委托——代理理论、绩效管理理论、系统论及控制论等内部控制理论,详细介绍了本文的研究基础,为后文的撰写展开铺垫。第三部分是内部控制运行有效性的影响因素,通过对控制环境、风险评估、控制活动、信息与沟通及内部监督五大影响因素进行细致分析,能够更好的理解这些因素是如何影响内部控制的运行效果。第四、五部分主要是对我国高校在运行过程中存在的共性问题进行归纳总结,突出重点问题,并针对这些问题从内部控制角度提出符合我国高校发展的、有利于提升内部控制运行有效性的建议。第六部分是研究结论与展望,其研究结论为:不管是国家重点院校还是普通院校,内部控制运行情况都不是完美无缺的,高校必须建立内部控制制度体系并使之得以良好运行,才能实现发展目标;内部控制是一个复杂且艰巨的过程,需要管理者根据内外部环境的变化,反复修改适合本校的内部控制制度;内部控制需要全员参与,不仅需要管理者制定内部控制制度,并且需要全体员工来共同执行,只有将内部控制工作渗透到每个角落,才能让制度健康有效地运行。