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基因组DNA包含了细胞的绝大部分遗传信息,在真核生物细胞中,DNA缠绕在组蛋白八聚体上形成核小体,核小体进一步凝聚成染色质。DNA和组蛋白上的共价修饰也会影响相应区段基因的转录,构成了DNA序列以外影响基因表达的另外一层信息。水稻基因组的重复序列和转座子元件占基因组的40%左右,并且很多转座子序列与基因相邻,而DNA甲基化主要发生在重复序列和转座子元件上,所有水稻中DNA甲基化对调控基因表达和生长发育非常重要。本博士论文详细地分析了水稻幼苗组织中基因组DNA甲基化图谱,研究了水稻染色质变构因子DDM