大鳍鳠(Mystus macropterus Bleeker),属鲶形目(Siluriformes)鲿科(Bagridae)鳠属(MystusScopoli)。分布于长江和珠江水系,为我国特有经济鱼类,具有肉质细嫩、骨刺少、味道鲜美、经济价值高的优点。目前,对大鳍鳠的研究主要集中在形态学、繁殖生物学、池塘驯化、养殖技术以及能量学上的研究,对其种质资源状况、遗传多样性现状和线粒体控制区结构方面的研究还比较薄弱。近年来,由于长江干流大型水电枢纽工程,如葛洲坝、三峡大坝等的建成,引起了许多学者对三峡库区鱼类种质资源状况的研究,但是对大鳍鳠的研究甚少,大坝的建成可能造成其生活环境的改变、产卵场地的破坏以及生殖隔离的产生,这些是否使大鰭鳠遗传结构及多样性现状也受到了一定的影响是一个值得深入研究探讨的问题。因此,从DNA分子水平对大鰭鳠种群遗传结构及基因多样性状况进行研究是很有必要的。本文采用RAPD分子标记方法对长江流域(合川、广元、岳阳和金口)四个不同江段采集的野生大鰭鳠遗传多样性和种群遗传结构方面进行研究。研究表明:从16条引物产生的谱带中,总共获得139个位点,多态位点101个,多态位点百分率为72.66%。具体到每一群体,其多态位点比率为23.74%～39.57%,可见每一群体内的多态位点比率低于4个群体整体的多态位点比率;大鳍鳠群体内遗传多样性指数分别为:2.2237、1.9689、1.9356、1.0770,即岳阳群体最大,金口群体次之,合川群体再次之,广元群体最小;其Nei比Shannon估算的大鳍鳠群体的遗传变异指数低,但其遗传变异分布趋势基本上是一致的,即YY＞JK＞HC＞GY(岳阳＞金口＞合川＞广元),这一结果显示了4个群体遗传多样性及地理分布的差异状况,岳阳江段处于长江中游,上下游群体间基因交流频繁,且岳阳江段又与洞庭湖等湖泊相连,使得该处的大鳍鳠群体内交流机率较其他流域高出许多,而广元位于长江上游的支流,群体间的基因交流较少,故其多样性指标较低;大鳍鳠四个群体遗传相似度和遗传距离研究表明:大鳍鳠群体间的遗传相似度的变化范围为:0.7490～0.9678,岳阳群体和广元群体遗传相似度最低为0.7490,岳阳群体和金口群体相似度最高为0.9678;同时,岳阳群体和金口群体的遗传距离最小,广元群体和岳阳群体的遗传距离最大,分别为0.1015和0.2890,这与UPGMA聚类图显示的结果一致,金口群体和岳阳群体首先聚类,然后聚类的是合川群体和广元群体,最后,这两个类群再聚类;遗传分化系数Gst为0.4053,即40.53%的遗传分化发生在群体之间,有59.47%的遗传分化发生在群体内。本文还对大鰭鳠线粒体控制区序列进行了扩增,通过与已发表的长吻鮠(Leiocassislongirostris)、圆尾拟鲿(Pseudobagrus tenuis)和光泽黄颡(Pelteobagrus nitidus)mtDNA控制区序列进行比较分析,发现大鰭鳠线粒体控制区序列有A、T含量高,G含量低的特点。同时,大鰭鳠线粒体控制区包括三个主要识别区域:扩展终止相关序列(extended terminalassociated sequence ETAS)、中央保守序列(Certrol conserved sequence block)、保守序列(Conserved sequence block)。其ETAS序列为:TACATTAATGTGCTATGGTATAGT;中央保守序列中的CSB-F的序列为:ATGTAGTAAGAAACCACCAACCCTCAAT,CSB-E序列为:AGGGCAATAATAGTGGGG,在鲿科鱼类中的普遍序列为:AGGGCAA--A-T-GTGGGG,含有GTGGG-box的稳定结构,CSB-D的序列为:TATTACTGGCATCTGGTTCCTA;保守序列中CSB-1的序列为:ATATAATGCATGTTTTAATAACATA,CSB-2序列较易识别,为TAAACCCCCCTACCCCC,CSB-3为:TGTTAAACCCCTAAACCAG。大鳍鳠在不同的种属间存在大致相同的保守区段:ETAS结构、CSB-D、CSB-F、CSB-E、GTGGG-box结构,CSB-1、CSB-2、CSB-3,其中CSB-D和GTGGG-box结构很保守,而CSB-F、CSB-E、CSB-2、CSB-3存在个别碱基的变异。