近年来，越来越多的研究表明钌配合物具有比铂类配合物更低的毒性以及较高的抗癌活性，因此成为人们研究的焦点。文献报道钌配合物中的钌（II）芳烃配合物最具代表性，因此本篇文章主要应用密度泛函理论（DFT）对具有抗癌活性的钌（II）芳烃配合物与各靶分子之间的作用机理进行了理论研究。在第三章中，我们主要研究钌配合物Ru（η⁶-C₆H₅（CH₂）₂OH）Cl₂（DAPTA）（DAPTA=3,7-diacetyl-1,3,7-triaza-5-phosphabicyclo[3.3.1]nonane）的一水解和二水解配合物与鸟嘌呤，腺嘌呤，胞嘧啶，半胱氨酸和组氨酸的相互作用机理，目的是探讨此配合物的最优靶点是DNA碱基还是氨基酸残基。计算结果表明，二水配合物在动力学上优于一氯一水配合物。一氯一水配合物取代反应中的活化自由能的顺序是G>His>A>Cys>C，表明一水配合物更易与胞嘧啶作用。二水配合物取代反应中的活化自由能的顺序是G>C>A>His>Cys，表明二水配合物的优先靶分子是氨基酸残基。在第四章中，我们主要探讨Ru（II）芳烃配合物[Ru（η⁶-p-cymene）Cl₂（PTA）]（RAPTA-C）,[Ru（η⁶-C₆H₅（CH₂）₂OH）Cl₂（PTA）]（RAPTA-OH）（PTA=1,3,5-triaza-7-phosphatricyclo[3.3.1.1]decane）,[Ru（η⁶-p-cymene）Cl₂（DAPTA）]（DAPTA-C）和[Ru（η⁶-C₆H₅（CH₂）₂OH）Cl₂（DAPTA）]（DAPTA-OH）与鸟嘌呤，腺嘌呤和半胱氨酸的单功能取代反应。同时也探讨RAPTA-C和RAPTA-OH配合物的活性是否是PTA配体质子化所致。最后探讨了外加H₂O分子对RAPTA-C和RAPTA-OH配合物的活性影响。研究结果表明，PTA配体质子化并不完全是RAPTA-C和RAPTA-OH配合物的活性影响因素。同时外加的H₂O分子对RAPTA-C和RAPTA-OH配合物的活性具有一定的影响。