猪δ冠状病毒（porcine deltacoronavirus,PDCoV）是冠状病毒科的新成员,能够引起母猪和哺乳仔猪发生腹泻、呕吐、脱水等临床症状,哺乳仔猪的死亡率可达40%,是危害养猪业的严重疫病之一。为了解PDCoV在四川地区的分子流行情况,本研究从四川各地区猪场收集的共计634份临床腹泻样本进行RT-PCR检测,并通过对4株四川地区的PDCoV病毒株进行全基因扩增与分析,以了解四川PDCoV病毒株的基因组与遗传系统发育特征。结果显示腹泻猪群中PDCoV的阳性率较低,仅为13.25%（84/634）,而猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）的阳性率高达32.18%（204/634）,同时结果显示PDCoV可与PEDV混合感染猪群,且阳性率为7.14%（47/634）。另外统计学分析显示PDCoV感染仔猪的几率比母猪高约2.77倍,且猪群在春季和冬季发生PDCoV感染的几率要比夏季高约3.30倍。全基因组测序分析显示4株PDCoV病毒株之间的同源率为98.9%-99.3%,而与其它参考PDCoV病毒株间的同源率为97.6%～99.0%。4株PDCoV的全基因组中均有部分碱基的插入或缺失,包括非结构基因2（non-structural gene 2,ns 2）上的6-nt的缺失、ns 3基因的9-nt插入、S基因的3-nt缺失以及独特的3′UTR的11-nt缺失。全基因遗传进化树分析显示,PDCoV病毒株呈现出明显的地域特征,同时4株PDCoV病毒株与其他中国PDCoV病毒株处于同一大分支,但又各自处在不同的2个小分支中。同时S基因遗传进化树分析显示测序的其中1株病毒株与其他国家PDCoV病毒株组成一个大分支,表明四川地区PDCoV病毒株的基因多样性。本研究丰富了PDCoV在中国的分子流行特征及其遗传进化规律,为后续PDCoV病毒学研究提供参考。另外本研究为建立了一种可靠的检测PDCoV IgG抗体的间接ELISA方法,以了解四川地区PDCoV抗体的流行情况。本研究采用原核表达系统表达PDCoV膜蛋白（M）作为检测抗原,通过反应条件的优化,建立了基于PDCoV M蛋白的间接ELISA方法,命名为PDCoV-r M-ELISA,并用该方法对430份临床样品进行检测。结果显示本研究成功构建了重组表达菌BL21-pET-32a-M,且将重组表达菌经诱导表达后获得了重组M蛋白,Western bolt检测表明重组蛋白具有良好的反应原性。以其作为包被抗原建立的PDCoV-r M-ELISA方法仅对PDCoV血清检测为阳性,与猪流行性腹泻病毒等5种猪常见病原阳性血清均无交叉反应,具有良好的特异性;该方法灵敏性高、重复性好,批间和批内重复性变异系数均小于10%;与成品化PDCoV抗体检测试剂盒同时检测48份临床血清,两种方法的阳性符合率为88.46%,阴性符合率为90.91%,总符合率为89.58%。临床样品检测结果表明四川地区PDCoV抗体阳性率平均为11.86%,且结果显示在健康猪血清中也可检测出抗体。总之,本研究成功表达了PDCoV M蛋白,建立了PDCoV-r M-ELISA检测方法,该方法具有较高的敏感性,良好的特异性和重复性,可用于临床猪血清样品种PDCoV IgG抗体的检测。