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水稻(Oryza sativa)是世界一半以上人口的主食,如何提高水稻单位面积产量一直是科学研究与育种研究关注的重点。株型是一个与水稻产量密切相关的农艺性状,其中,分蘖角度与水稻株型建成直接相关,枝梗角度与水稻穗部疏密程度密切相关。因此,分蘖角度和枝梗角度是两个重要的农艺性状。本研究利用长雄蕊野生稻和粳稻品种中花11杂交构建F2作图群体,考察各单株分蘖角度和枝梗角度;用均匀覆盖水稻基因组的125对多态性分子标记,构建了长雄蕊野生稻InDel分子连锁图谱;利用QTL分析软件QTL IciMapping4.0,采用完备 CIM(Inclusive Composite Interval Mapping,ICIM)方法对水稻分蘖角度和枝梗角度进行QTL初步定位及遗传分析,主要结果如下:1、两亲本分蘖角度和枝梗角度差异极显著,分蘖角度分别为41.67 ±12.50°和4.22±0.83°,枝梗角度分别为41.67±5.59°和0±0°。F2群体分蘖角度和枝梗角度呈连续分布,说明分蘖角度和枝梗角度性状属于数量性状。2、利用930对覆盖水稻全基因组的InDel分子标记对亲本进行多态性检测,共筛选到125对均匀分布于12条染色体上的多态性InDel分子标记,构建了一张遗传图距总长为1455.3cM,分子标记间平均遗传距离为11.6cM的长雄蕊野生稻遗传连锁图谱。3、共检测到3个与分蘖角度相关的QTLs(qTA-1-1、qTA-3-1和qTA-7-1),分别位于1、3和7号染色体上,共解释了 20.98%的表型变异率,其中,qTA-1-1可以解释6.41%的表型变异,是一个新发现的分蘖角度QTL;qTA-7-1解释了 7.84%的表型变异,包含了一个普通野生稻分蘖角度调控基因PROG1。对亲本进行比较测序,发现PROG1编码区有一个18bp的InDel、15bp的InDel、两个3bp的InDel和5个SNP差异,该差异造成长雄蕊野生稻和中花11中PROG1编码蛋白的不同;4、共检测到3个与枝梗角度相关的QTLs(qBA-2-1、qBA-4-1和qBA-7-1),分别位于2、4和7号染色体上,共解释了 19.58%的表型变异率。在检测到的3个QTLs中,qBA-2-1和qBA-7-1是新检测到的枝梗角度QTL基因座。另外一个QTLs位点与已克隆或精细定位的QTL位置相同或相近。本研究未检测到分蘖角度和枝梗角度主效QTL,调控分蘖角度和枝梗角度性状的QTLs分布于在多条染色体上,构建了第一张高密度长雄蕊野生稻InDel标记遗传图谱,定位到了分蘖角度、枝梗角度新QTL基因座,为进一步精细定位以及育种家利用分子标记辅助选择优良性状打下了基础。