随着全球范围内的环境问题日益严重,人们对环境保护的关注程度得到了不断的提高。排污权交易这一基于市场的体系应运而生,它以节省成本的方法给企业提供了一种灵活的达到排放限值的途径,可以缓解经济增长和环境保护之间的尖锐矛盾。点源—点源间的交易是最初最基本的水域排污权交易类型,然而,对于目前的污染现状,通常采用的点源—点源之间的排污权交易方法难以进一步的提高环境质量,尽管有种种的不确定性因素制约,点源与非点源之间的排污权交易的巨大成本节省潜力仍然使得其受到广泛关注本文采用基于多主体系统的建模方法进行模拟,这种方法与通常的数理模型及仿真模型均不相同,是采用自下而上的方式观察系统要素之间的相互作用及其整体涌现现象的演化过程以更好的研究和解释事物的本质。本文的基于多主体系统排污权交易模型在分析总结前人研究成果的基础上,考虑了在每个周期末排污要求减少量有微小增长的系统,并在模型中加入了与点源的边际减排系数有极大差别的非点源进行模拟,此外,模型中还考虑了由于非点源的不确定性所带来的成本节省影响,较好的模拟了真实的排污权交易市场。在通过分析多次实验模拟结果后,本文认为,第一,当只有点源存在时,区域的环境质量以及企业的成本节省难以得到进一步的提升；第二,在理想状况下,排污权系统中加入了非点源即可满足区域内的环境目标且企业能获得更大的成本节省；第三,在现实中,只有在非点源监管的不确定性以及点源与非点源交易时的风险态度因素这两者的影响均较小的时候,该排污权交易系统才是成本有效的,且同时该区域的非点源污染减少量及总污染减少量才会越来越少,此时区域的环境质量才能得到不断的提高。