青钱柳属是中国特有的单种属植物，它是中国亚热带最广泛分布的植物之一。在这项研究中，本文利用青钱柳的叶绿体两个片段序列（atpB-rbcL，psbA-trnH基因间隔区）和核基因的一个片段序列（PHYA）检测了青钱柳遗传结构和现有分布格局与前第四纪事件的关系。该文总共收集了青钱柳43个居群，共338个个体。研究结果表明青钱柳具有18种叶绿体单倍型和76种核基因单倍型，发现青钱柳具有较高的遗传多样性（cpDNA HT=0.872，nDNA HT=0.940）。基于叶绿体数据的居群间遗传分化（Gst=0.94）显著性高于核基因检测到的遗传分化系数（Gst=0.04）。叶绿体数据和核基因数据都没有检测到明显的谱系地理结构（Nst＞ Gst, P＞0.05）。对叶绿体的18种单倍型进行系统发育关系重建，发现可以分为两个世系(Ⅰ，Ⅱ)。对叶绿体和核基因数据进行失配分析以及贝叶斯天际线分析，结果都表明了种群近期发生了扩张，扩张事件发生在0.27 Ma。采用了两个化石标定点利用BEAST软件计算分化时间，表明叶绿体两个世系的分化时间发生在渐新世向中新世期过渡的时期(18.01 Ma)，与亚洲内陆干旱事件紧密相关，世系内的绝大多数单倍型在中新世期间发生分化，说明了青钱柳具有漫长的进化历史，这与以前的系统发育分析以及化石记录是一致的。综合分子系统发育数据、古气候资料以及叶绿体单倍型的地理分布信息，发现青钱柳现在的分布区中在第四纪冰期具有多个避难所，其中云贵高原和武夷山脉是最为重要的避难所。