在已有的相关研究成果基础上，本文从生态安全的角度对农用地进行了基于GIS的农用地生态安全评价研究。着重进行了农用地生态安全评价的指标体系、评价标准、评价方法的研究，以及如何利用GIS进行实证评价。基于生态安全评价是为区域农业可持续发展提供决策依据的理论指引下，本文对农用地生态安全评价的原则、指标体系和评价标准的构建思路、方法等进行了系统论述，提出了一套以河南省为例的省域尺度的农用地生态安全评价的指标体系及评价标准，并且在已有的评价方法基础上结合GIS技术和农用地生态安全评价的特点提出了一种评价方法；最后，利用MapGIS软件以河南省为例进行了实证研究并提出了解决农用地生态安全问题的对策和措施。本文有如下特色：一、指出生态安全是指人类赖以生存的生态条件是否安全以及生态系统提供的服务是否安全，包括生态系统自身安全、服务质量和数量是否异常以及对于人口数量日益增长和需求不断变化的人类来说是否可持续。在前人研究的基础上强调了面临人口数量和需求变化时安全的可持续，而不仅仅是现状的安全。二、较系统的论述农用地生态安全评价指标体系和评价标准构建思路、确定方法等，并且结合河南省实际提出了一套河南省省域尺度农用地生态安全评价指标体系和评价标准。三、提出的“多因素系统聚类指数法”，将各评价单元进行聚类与根据评价单元不安全分值的折线图变化趋势互相调整划分级别的综合，使得级别划分既体现各级别差异，同时体现同一级别内各评价单元良好的相关性，这样得出的评价结果更加客观、准确。四、在前述研究的基础上指出，在全球变化研究广泛开展的背景下，生态安全评价不仅要为区域农业可持续发展提供决策依据，更应该为改善整个生态环境提供理论基础和决策依据，从而拓展了生态安全评价的内涵，为生态安全评价的进一步研究指明方向。