禽流感(Avian Influenza,AI)是由正粘病毒科流感病毒属A型流感病毒引起的家禽和野禽的一种从呼吸系统到全身败血症等多种疾病综合征,其中高致病性禽流感被国际兽医局列为A类传染病,是我国的Ⅰ类传染病,每次暴发都带来了极其巨大的经济损失。野鸟被认为是禽流感病毒(Avian Influenza Virus,AIV)的天然宿主,因其本身具有的迁徙习性,为病毒的传播提供了天然的有利条件,一直被作为禽流感主动预警的监测对象。哨兵动物可以被用作各种健康风险的监测,比如与食物有关的危害、传染病和生物恐怖主义的哨兵,简单地说,哨兵动物可以被定义为“疾病存在的指示器”。本研究选择结合哨兵动物进行禽流感监测研究的原因有二:一、为实现野鸟携带禽流感病毒的主动预警工作,研究人员通常选择野外环境下的野鸟粪便作为样品采集对象,但由于野生水禽栖息地主要集中于沼泽、湿地、湖泊等水域面积广阔、周围环境复杂的地点,且野生水禽本身具有群体数量大、活动范围广的特点,研究人员难以实现对某一区域内的野鸟进行全面、系统的采样,往往会导致样品代表性降低、监测结果不理想,而在监测区域内引入哨兵动物并定期为哨兵动物进行检查和检测,就可以及时发现病原存在,弥补常规监测费时费力和病原查出率低的不足。二、通过监测野鸟和哨兵动物之间流感病毒及其基因相互流动情况,可模拟自然状态下野鸟和家禽之间禽流感病毒的相互传播情况。也就是说,结合哨兵动物对野鸟流感进行监测研究,可以实现成本最低化、效果最大化的实时监测。本研究于2017年1月至2019年4月在湖北地区进行野鸟携带禽流感病毒的主动监测,共采集野鸟及哨兵动物粪便和拭子样品共10732份,结果共分离到39株AIV,AIV的总体分离率为0.363%。亚型鉴定结果显示,分离到15株H1N1、1株H1N2、6株 H1N3、1 株 H1N9、1 株 H3N2、1 株 H3N8、6 株 H4N6、2 株 H4N9、1 株 H5N8、3株H6N2、1株H9N2和1株H11N9。其中,H1N1为湖北网湖地区优势毒株。哨兵动物样品中分离出1株H3N2和1株H3N8亚型禽流感病毒,其中H3基因仅从哨兵动物样品中分离到,未在野鸟样品中分离出,N2和N8基因也与野鸟样品中分离到的病毒具有不同的进化来源,验证了哨兵动物作为野生水禽流感监测补充模型的可行性。遗传进化结果显示:湖北地区野鸟携带的禽流感病毒具有丰富的基因来源,与亚洲、非洲、欧洲及北美洲多个国家和地区的AIVs均存在基因交流。说明湖北作为候鸟“中亚”和“东亚一澳大利亚”迁徙路线上的重要停歇地,禽流感病毒间存在着频繁的基因交流。