土生空团菌(Cenococcum geophilum Fr.)是一种重要的外生菌根真菌,具有突出的抗旱性。其地理分布和寄主范围都非常广泛。目前,国内关于土生空团菌遗传多样的研究还很少,因此,本文对35个中国菌株和4个法国菌株的rDNA ITS区域和18S、28S rDNA中Ⅰ型内含子进行测序,结合GenBank的相关数据,分析其核苷酸序列差异和RNA二级结构特征,进一步研究影响土生空团菌遗传分化的因素。主要结果如下：1、土生空团菌rDNA ITS区序列长度为422bp～447bp,显示出93.8%～100%的同源性。其中ITS1和ITS2区均可形成稳定的RNA二级结构,表明它们在rRNA转录后加工中发挥着作用。系统发育分析表明每个地区的土生空团菌都有一定的遗传多样性；其中聚在一起的菌株基本来源于相同地理区域,而菌株的亲缘关系与寄主没有明显相关性。2、34个中国土生空团菌有22个菌株在18S rDNA中有Ⅰ型内含子。序列分析表明18S rDNA中的Ⅰ型内含子序列长度为488bp-590bp。其5’端序列比较保守,3’端序列有差异。二级结构显示Ⅰ型内含子有10个配对区(P1～P10),P5区域由P5, P5a, P5b, P5c, P5d组成,P9的3’端有2个配对区(P9.1、P9.2)。系统发育分析表明每个地区的土生空团菌有一定的遗传多样性；其中遗传多样性和地理区域有很大的关系,和寄主没有明显相关性。3、34个中国土生空团菌有21个菌株在28S rDNA中有Ⅰ型内含子。28S rDNA中的Ⅰ型内含子序列长度为570bp～607bp。其5’端序列有差异,3’端序列比较保守。二级结构显示28S rDNA中的Ⅰ型内含子有10个配对区(P1～P10),P1区域由P1,Pla, Plb组成,P5区域由P5,P5a, P5b,P5c组成。由于没有土生空团菌28S rDNA中内含子序列的报道,无法进行全面的系统发育分析。