猪繁殖与呼吸综合征病毒SCQ株ORF5基因的克隆、生物信息学分析及dORF5基因原核表达的初步研究

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GP5是猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的重要结构蛋白和免疫保护蛋白之一,能够诱导机体产生中和抗体,目前被认为是研制PRRS新型分子诊断试剂和新型疫苗的良好侯选材料。 本研究从单层细胞MARCO-145感染PRRSV SCQ后提取总RNA,应用RT-PCR方法扩增得到PRRSV-SCQ株ORF5基因并将其克隆至PMD18-T载体。应用生物学软件及互联网在线服务器对PRRSV-SCQ株GP5蛋白进行了疏水性、跨膜区、信号肽、潜在抗原位点和二级结构等的预测,并初步讨论了其结构与功能之间的关系。GP5蛋白一共含有3个跨膜区,6个潜在抗原表位和一段位于N端1-31位氨基酸信号肽,C端则含有多个无规则螺旋卷曲。在了解这些预测结果的基础上,设计一对引物,应用PCR方法从重组质粒PMD-18-T-ORF5中扩增得到缺失了N端信号肽序列(同时也是疏水跨膜区)但保留了主要抗原表位编码区的基因片段dORF5,将dORF5克隆至原核表达载体PBAD/Myc-His B上,经菌落PCR方法、酶切以及测序鉴定,证明成功地构建了重组表达质粒PBAD/Myc-His B-dORF5。将该重组质粒转化大肠埃希氏菌TOP10感受态细胞,经阿拉伯糖诱导表达,SDS-PAGE可检测到分子质量约为19.4kDa的目的蛋白。目的蛋白经蛋白质分析软件Bandscan分析,结果表明表达的量占菌体总蛋白的17.1%;Western-blotting分析表明,该重组蛋白可被兔抗PRRSV血清所识别,具有免疫原性。这为进一步研究GP5蛋白的结构、功能和开发新型诊断试剂盒、新型疫苗提供了理论与物质基础。同时也证明了生物信息学在指导实验设计方面有重要意义。
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