随着我国城市化进程的加快，经济发展对城乡土地资源的需求空前提高。人地矛盾日益突出、生态空间不足、农村地区发展滞后等问题制约着城市可持续发展。上海市作为中国国际化大都市的典型代表，长期以来高度重视土地整治工作。农用地整治活动的广泛开展，不仅有利于改善土地利用结构，也为提高农用地产出水平、助力农村地区经济社会转型发展奠定了坚实的基础。在倡导绿色低碳、生态文明发展方式的新形势下，探索农用地整治活动对区域生态环境影响及其碳效应研究对于我国探索绿色低碳发展道路具有重要意义。当前已有学者对于农用地整治对区域生态环境影响进行相关评价分析，但有关整治工程对区域生态碳库的测算方面的研究成果尚不充足，缺乏科学有效的碳效应测算方法和低碳减排措施。因此，本研究选取上海市松江区新浜镇土地整治项目作为研究区域，基于IPCC温室气体清单和国内外最新研究成果，从整治工程实施碳效应、土地结构变化碳效应、土地利用方式碳效应三方面进行碳效应测算，分析整治工程前后项目区碳效应变化特征。并模拟不同政策下研究区碳排放情景，分析影响CO2减排的关键因子。　　根据测算结果可知，研究区农用地整治工程措施的碳排放总量为13016.92t，土地利用结构变化使耕地碳储量增加5072.34t，土地利用方式变化带来研究区年净碳汇量约为3296t。水泥作为消耗物料是工程施工中主要的碳排放来源，占总碳排放量95%以上；田间道路工程是主要的碳源工程，占工程施工总碳排放量的53.34%。整治工程能源与工料消耗存在碳足迹赤字现象，碳源材料的消耗量以及CO2排放系数是影响土地整治工程CO2排放量的主要因素；农田防护林建设、新增耕地面积、及农业生产条件改善提升粮食产量是改善区域碳汇的主要因素。因此，本文从工程减排增汇技术和政策两方面对低碳农用地整治提出建议。在技术方面，创新低碳工程实施技术，提高施工机械节油，注重农田景观恢复和建设，加强农田林网建设等对实现低碳土地整治具有良好效果；在政策方面，从项目规划设计、监督管理、后期验收等方面对整治工程实施全流程有效管理对保障研究区生态环境优化具有积极意义。