随着我国高等教育体制和公共财政体制改革的深化,国家“科教兴国”与“人才强国”战略的实施,高等学校已成为国家基础研究的主力军和高新技术研究的重要力量。因此越来越多的资金投入到高校科研领域,经费来源也呈现出多渠道、多元化发展。科研经费成为高等学校提高科技水平、培养创新人才、促进学科发展、全面提升高校综合实力和竞争力的重要保障。但是多年来形成的科研经费管理的模式和运行机制已不能适应新形势的要求,直接制约着科研管理水平,影响科研效益的实现,因此正确认识高校科研财务管理的重要性,分析高校科研经费管理机制存在的问题,构建完善系统的科研经费管理体系,加强科研财务管理控制职能,提高科研经费使用效益,成为现阶段高校科研经费管理工作面临的新挑战。本文的研究目的就是拟通过对科研管理相关理论的研究,结合L高校科研管理中出现的问题,探究科研经费管理模式及运行的现状,针对科研项目的预算管理、会计核算、过程控制、项目结题、成果转化、绩效评价等完整流程的分析,系统归纳该高校科研经费管理模式面临的问题,例如:预算管理机制不完善、监督机制缺失、经费成本核算不健全、部门间沟通协调不畅等问题,并透过多角度、多层次分析其产生的原因以及内外部环境影响。通过借鉴国内外成熟的科研经费管理理念及模式,提出完善和解决这些问题的对策与措施;通过科学化、精细化的管理,贯彻“量入为出,统筹兼顾”的管理理念,准确反映高校科研项目的实际运行状况;通过信息化建设,搭建信息共享平台,优化目前高等学校科研经费管理模式。从而解决L高校科研经费管理体制中存在的问题,提高科研经费使用效益,保证其社会效益、经济效益的实现。