本文试图通过对我国股票市场上公司购并中存在的产权制度问题、代理问题等的分析，运用新制度经济学和现代产权理论中的交易成本理论作为分析工具，以信息问题和激励问题作为展开的主线，以产权制度作为分析的核心，用理论与实证结合的方法，说明我国股市资源配置功能的缺陷，并据此提出改革的建议。全文分为四部分：第一部分：理论工具概述，解决判断股市资源配置效率的标准问题和工具问题。第二部分：通过对上市公司购并案例的分析，归纳出其存在问题。第三部分：运用理论工具，分析我国产权制度、股市制度、企业制度中存在的信息问题和激励问题，以及由此导致的交易成本过高的问题，从而解释上市公司购并和股市资源配置低效率的根本原因是产权制度缺陷、直接原因是股票市场机制缺陷。第四部分：以上述论证为基础，提出改革的政策建议：改革产权制度和股权制度、调整股票市场功能定位、以存量发行代替增量发行、择优上市和亏损摘牌、建立有效的信息披露和监督制度、加快证券中介机构建设等。