玉米茎腐病是一种严重的危害玉米生产的土传性病害，在世界各地玉米产区普遍发生。玉米茎腐病的病原菌比较复杂，我国以腐霉菌和镰刀菌为主。本实验用禾谷镰刀菌 (Fusariumgraminearum Schwade) 对亲本1145(抗病)和Y331(感病)及其分离后代群体(BC<,1>、BC<,2>、BC<,3>、F<,2>和DH系)进行连续三年的人工接种，采用分级方法测定抗性，结合多态性SSR标记对抗病基因进行QTL定位，在主效抗病QTL区域进一步发展标记对其进行精细定位，在不同的回交世代分析主效QTL的抗性效应，具体研究结果如下： 1．从630对SSR分子标记中筛选出扩增效果良好且亲本间表现多态性的SSR标记118对，对由47个高抗和47个高感BC<,1:2>家系植株组成的极端定位群体进行基因型鉴定。除了umc1800(位于第5条染色体)和umc1257(位于第7条染色体)外，其余的116个SSR分子标记能够被整合到遗传图谱中，最终构建的遗传连锁图总遗传距离为1633cM，分子标记平均遗传距离为14cM。 2．利用QTL CartographerV2.0软件和复合区间作图法对抗茎腐病基因进行QTL定位和分析。模拟运算1000次，当LOD>3.1时，全基因组扫描共检测到2个QTL，分别位于第1和第10染色体上，均表现为加性效应且增效基因均来自1145。其中位于第10条染色体上的QTL位点qSRR-1在SSR分子标记umc2349-umc1115之间，LOD值达到13.1，可以解释的表型变异为36.3％，是一主效QTL；位于第1条染色体上的QTL位点qSRR-2在SSR分子标记mmc0041-umc1774之间，LOD值达到3.8，可以解释表型变异的8.9％。 3．通过对BC<,2>、BE<,3>、F<,2>和DH系的进一步鉴定，发现当主效QTL区域的染色体片段都来自1145(基因型：qSRR-1//qSRR-1)或杂合 (基因型：qSRR-1//qSRr-1)时，抗病率都在70％以上；相反，当主效QTL区域基因型与Y331完全一致(基因型：qSRr-1//qSRr-1)时，抗病率小于30％，说明抗茎腐病主效OTL—qSRR-1的效应能稳定遗传。 4．通过网络资源搜索了qSRR-1区域内的所有序列信息(包括BAC末端、EST和IDP标记)。通过设计引物、亲本PCR扩增、序列多态性分析等，共发展了5个标记，分别是AI857162SR、AI861111SR、AI8571626SR、CB351276SR和AF0433464SR。加上现有的6个SSR标记，在qSRR-1区域内共有11个分子标记，这些标记可用来对主效QTL精细定位。 5．用qSRR-1区域内的11个分子标记筛选BC<,3>代群体，发现13种重组类型，共计25个重组单株。每个重组单株继续回交获得BC<,4>家系种子，将BC<,4>的种子分成两部分，一部分自交形成BC<,4>F<,2>群体用于进一步抗性鉴定；一部分将利用标记辅助选择发展BC<,5>代群体。通过对BC<,4>代每个个体的基因型和抗病性鉴定可以准确定位主效抗病QTL—qSRR-1，从而为主效抗病基因的克隆打下坚实的基础。