专业镇是以某一种或二种产业的专业化生产为主的城镇，作为产业集群的一种类型，它已成为珠三角镇级经济单位的一种主要发展模式。由于专业镇是具有中国本土特色的产业集群，对专业镇的研究是具有中国特色的理论研究探索；在全球化和知识经济的背景下，创新发展观已成为新的区域发展观，从创新系统角度研究专业镇是一个新的研究方向和热点。 　　首先，通过全面系统地分析珠三角专业镇的形成背景、过程、模式、空间分布和动力机制的基础上，论述创新在专业镇发展过程中的作用。本文认为，珠三角专业镇的发展过程是一个产业专业化、政府逐渐引导、不断创新、区域协调和路径依赖的过程，发展的基本模式可分为内生型专业镇和外生型专业镇。 　　其次，提出珠三角专业镇创新系统的概念、特征以及其理论框架，并重点分析创新系统的行为主体、环境条件、网络和功能、运行动力机制和过程。 　　再次，本文依照专业化产业技术特征、生成模式、网络结构特征等选取位于珠三角东、中、西部三个专业镇，即花都区狮岭皮革皮具专业镇、中山市南头家电专业镇、东莞市石龙专业镇，分别分析其专业镇发展(即发展轨迹、发展主要原因和存在问题)、创新系统(即行为主体、环境、网络和运行机制)以及针对狮岭镇和南头镇的专业化产业的生产企业的调查问卷分析，然后对比三个专业镇创新系统的共性和特性，总结出三个不同专业镇创新系统模式，即以传统产业为主的内生型专业镇创新系统模式、以信息产业为主的外生型专业镇创新系统模式和以家电产业为主的内外生结合型专业镇创新系统模式。 　　最后，从空间整合的角度来分析专业镇创新系统，在珠三角范围内，珠三角创新系统、珠三角几大中心城市——香港、广州、深圳、珠海等如何影响专业镇创新系统；在全球范围内，专业镇如何沿全球价值链体系与外部区域良性互动，以促进专业镇产业升级。