假单胞菌Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的内源竞争RNA研究

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhouyong
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
非编码RNA是一类新型的基因调控因子,具有多种生物学功能,其中的内源竞争RNA(ceRNA)可以参与植物中的多种生物胁迫响应机制,包括对根结线虫侵染的响应。诱导抗性可挖掘植物体潜在的免疫机能,作为ceRNA,如何参与到生防菌诱导的抗性已经成为植物病害防治研究的新热点。本文利用前期筛选到的可诱导番茄抗南方根结线虫的恶臭假单胞菌Sneb821处理番茄并进行全转录组测序,率先分析参与到生防菌诱抗过程中的非编码RNA,利用番茄毛状根技术和基因沉默技术验证miRNA、lncRNA、circRNA等ceRNA在生防细菌诱导番茄抗南方根结线虫过程中的作用。研究结果如下:1.假单胞菌Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的ceRNA网络分析:高通量测序分析发现在Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的过程中,有38个miRNA表达上调,40个miRNA表达下调;43个lncRNA表达上调,35个lncRNA表达下调;18个circRNA表达上调,11个circRNA表达下调,并对这些非编码RNA的靶基因和来源基因进行了GO和KEGG注释。根据鉴定到的78个lncRNA、29个circRNA和78个miRNA构建了circRNA-miRNA-m RNA和lncRNA-miRNA-m RNA调控模块,从中发现了3个ceRNA,分别是lncRNA48734/miR156/SPLs(Solyc05g012040.2)、lncRNA47258/miR319/TCP(Solyc07g062680.1)和circR2g093210/miR482/NBS-LRR(Solyc05g009750.1)/(Solyc04g007320.1)。2.假单胞菌Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的miRNA研究:利用q RT-PCR技术验证6个已知miRNA(Sly-miR156e、Sly-miR319a、Sly-miR390a、Sly-miR394、Sly-miR396a和Sly-miR482d)和5个新颖miRNA(novel_miR_116、novel_miR_121、novel_miR_215、novel_miR_221和novel_miR_83)可能参与到生防菌的诱抗过程中,包括miR156/SPLs和miR482/NBS-LRR两个分子调控模块;通过短串联靶标模拟技术和番茄毛状根技术对miR156e和miR482d进行沉默,及其靶基因SPLs(Solyc05g012040.2)和NBS-LRR(Solyc05g009750.1)进行过表达研究,发现miR156e和miR482d及其靶基因可以调控番茄活性氧相关指标(SOD、POD、H2O2)的代谢途径,从而阻碍南方根结线虫的侵染;初步验证miR156e/SPLs(Solyc05g012040.2)和miR482d/NBS-LRR(Solyc05g009750.1)参与到Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的过程中。3.假单胞菌Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的lncRNA研究:利用RT-PCR技术验证番茄12个lncRNA(lncRNA18894、lncRNA21563、lncRNA24059、lncRNA25797、lncRNA35115、lncRNA39939、lncRNA47258、lncRNA44664、lncRNA45969、lncRNA48734、lncRNA51612和lncRNA7183)的表达可能参与到生防菌的诱抗过程,包括lncRNA48734/miR156/SPLs和lncRNA47258/miR319/TCP分子调控模块;通过番茄毛状根技术对lncRNA48734进行过表达研究,发现lncRNA48734可以靶向SPLs(Solyc05g012040.2)基因,并且可以调控番茄活性氧相关指标(SOD、POD、H2O2)的代谢途径,从而阻碍南方根结线虫的侵染;而通过VIGS技术对lncRNA47258进行沉默研究,利用番茄毛状根技术对靶基因TCP(Solyc07g062680.1)进行过表达研究,发现lncRNA47258及其靶基因可以调控番茄的茉莉酸合成途径,从而阻碍南方根结线虫的侵染并且抑制根结线虫的发育;初步验证lncRNA48734/miR156/SPLs(Solyc05g012040.2)和lncRNA47258/miR319/TCP(Solyc07g062680.1)参与到Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的过程中。4.假单胞菌Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的circRNA研究:利用PCR和Sanger测序技术,鉴定了Sneb821诱抗过程中番茄的9个circRNA,随后采用q RT-PCR技术验证circR1g108620、circR2g071350、circR2g093210、circR3g117980和circR4g074290等5个circRNA的表达可能参与到生防菌的诱抗过程中,包括circR2g093210/miR482d/NBS-LRR分子调控模块;通过番茄毛状根技术对circR2g093210及其靶基因NBS-LRR(Solyc04g007320.1)进行过表达研究,发现circR2g093210及其靶基因可以调控番茄活性氧相关指标(SOD、POD、H2O2)的代谢途径,阻碍了南方根结线虫的侵染;初步验证circR2g093210/miR482d/NBS-LRR(Solyc04g007320.1)参与到Sneb821诱导番茄抗南方根结线虫的过程中。本研究利用全转录组测序所挖掘到的番茄ceRNA调控模块,结合假单胞菌Sneb821可以调控番茄活性氧和茉莉酸合成途径的诱抗机理,从非编码RNA的角度挖掘和验证生防菌激发番茄对根结线虫免疫的全新分子机制。探索生防菌调控植物免疫抵抗线虫侵染的分子机理研究,特别是非编码RNA在该过程中的作用机制,为更全面深入地了解生防菌诱抗机理提供新的证据。
其他文献
试题情境的创设是试题编制的重要组成部分,它对学生物理核心素养的考查有着重要意义.运用情境类型学对武汉市2019-2021近3年的中考物理试卷进行了量化的比较与分析,基于研究结果,提出了增加情境的主题范围和真实性、增加情境化试题类型和提高核心素养中科学态度与责任的占比等意见和建议.
黑河口岸作为我国巩固沿边国防、联接俄罗斯及东北亚地区的桥头堡,地区铁路枢纽对加快构建黑龙江对俄铁路通道和区域铁路网,深化中俄资源能源合作,加快中蒙俄经济走廊、“一带一路”向北开放具有重要的战略意义。基于北黑铁路(龙镇至黑河段)升级改造工程,综合考虑黑河口岸地区中俄跨境铁路、韩呼黑铁路以及沿边铁路(黑乌段)规划预留及引入条件,结合黑河地区城市总体规划和铁路客货运量,分析研究黑河口岸地区铁路枢纽方案。
<正>今年前5个月,全国房地产开发企业到位资金同比下降26%,部分房企资金链断裂,碧桂园(2007.HK)却在6月份斥资提前赎回优先票据。而在此前,碧桂园、龙湖、美的置业3家房企成为首批启动信用保护工具成功融资的示范房企,并通过“债券发行+信用保护”的创新方式进行融资。在房地产行业持续低迷的环境中,碧桂园转型发展展示出其强劲的稳定性。
期刊
将劳动教育与综合实践活动课程渗透融合,有利于引领儿童在“活动+劳动”实践中,激发崇尚劳动的情感,树立正确的劳动观念,强化主动参与劳动的意识,在丰富知识和技能中塑造优秀品格,培养和发展创造能力。文章以陶行知劳动教育思想为指导,探讨基于儿童劳动意识培养的小学综合实践活动教学策略。
“宴乐”,是在宴饮过程中融入乐舞表演,包括“宴饮”和“乐舞”两部分内容。“钟鸣鼎食”一词说明,早在商周时期上层社会的宴饮中,已经有了乐舞表演。至宋代,由于市民阶层地位的提升,和社会经济的发展,“宴乐”活动愈加普通,富民与市民阶层也逐渐采用。随着“宴乐”的普及,此题材也被大量运用于中下层墓葬装饰之中,成就了宋墓华丽复杂的墓葬装饰。本文是对以壁画、砖雕、线刻、石雕为表现手法的宋墓“宴乐”题材装饰,进行
介绍了弯沉检测方法研究现状及各种方法的优劣。其中:贝克曼梁法和自动弯沉仪法技术简便,所测结果为静态弯沉,但效率低,目前研究主要集中在自动化改进以提高检测效率方面;落锤式弯沉仪法和激光式高速路面弯沉测定仪法检测结果为动态弯沉,检测效率高,但设备造价高昂,目前研究主要集中在对比试验相关性分析以及改进设备降低造价等方面。与落锤式弯沉仪相比,手持落锤式弯沉仪具有便携、造价低等优点,但主要用于科研,尚未列入
透镜是中考物理考查最为频繁的知识点之一,在初中教学以及初中考试评价的试题中,教师和命题人往往会通过使用凹透镜与凸透镜来判断是近视眼还是远视眼。文章对初中常见的科学性判断错误给出分析,并对几道中考物理试题进行分析和讨论,最后针对该部分的教学和试题评价提出相关的建议。
目的 明确露兜树Pandanus tectorius Soland叶绿体基因组的结构、序列特征和系统进化关系。方法 以露兜树叶片总DNA为材料,采用illumina NovaSeq高通量测序列平台进行叶绿体基因组测序,利用生物信息学工具对其进行组装、注释和特征分析,并基于最大似然法构建系统进化树。结果 露兜树叶绿体基因组呈典型的环状四分体结构,全长为157 747 bp,其中大单拷贝区的长度为85
中考复习作为初中物理知识点整合升华的重要环节,长期以来却一直秉持着简单“讲练结合”的陈旧模式.随着“双减”政策的落实,如何解决传统题海式复习模式导致的学生作业繁重、学生思维僵化、复习效果欠佳等弊端,已成为一线教师当务之急.本文分析初中物理复习的现状及弊端,认为“双减”背景下,教师应当采用当堂训练、思维导图、分层作业等综合性方法,激发学生学习的动力,培养学生创新性、开放性思维,实现减负、增效、提质的
目的 探讨基于微信平台的延续性护理对出院后精神分裂症患者生活质量及预后的即时性与延时性的影响。方法 采用方便抽样法,选取2018年5月至2019年7月从上海市长宁区精神卫生中心出院的100例精神分裂症患者作为研究对象。按照抽签法分为对照组(n=50)和观察组(n=50)。对照组给予常规电话随访,观察组在此基础上给予基于微信平台的延续性护理干预。所有患者均完成了6个月的干预,对照组44例、观察组50