认罪认罚从宽制度自推行以来,得到学界和实务界的高度关,适用率越来越高,重罪案件中的毒品案件认罪认罚从宽制度适用率也越来越高,到2020年,毒品犯罪和危险驾驶成为认罪认罚适用率最高的案件类型。但某类案件与认罪认罚从宽制度结合起来的研究成果相对较少,毒品案件的认罪认罚适用研究更少,针对这种情况,本文采用实证研究方法,以Y省S县法院2019年-2020年审结的毒品犯罪案件为样本进行整理、比对、分析,对毒品犯罪案件如何规范适用认罪认罚从宽制度进行研究。经整理发现,毒品犯罪案件在认罪认罚从宽制度适用数量上取得成功,但出现认罪认罚流于表面,“认罪”标准不明确;上诉率高于非认罪认罚上诉率,诉讼效率提升不明显;随着刑罚加重适用率越低等问题。存在的这些问题损害了制度的信誉和司法机关的权威,也侵害了被追诉人的权益。针对上述问题笔者从认罪认罚从宽制度适用中整体存在的不规范问题和毒品犯罪案件自身存在的问题出发,分析造成以上问题的原因。最后,围绕毒品犯罪案件适用认罪认罚从宽制度中存在的问题,笔者提出几点建议:一严格把握适用标准,在坚持证据裁判原则的前提下,对“认罪”做限缩解释;二是合理限制上诉权,控制“技术型上诉”和“投机型上诉”;三是规范司法机关权力,加强被追诉人自愿性保障;四是规范重刑案件适用范围,通过实体法改革明确量刑减让标准,激励被追诉人认罪认罚。