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冠状病毒是感染人和动物的一大类病毒。感染人类和动物的冠状病毒种类多样而且致病性和免疫特性存在明显差异。宿主在长期的进化过程中形成了一种抵抗病毒入侵的防御性抗病毒机制,即抗病毒天然免疫反应(innate immune response)。冠状病毒对宿主抗病毒天然免疫反应的调节机制至今不甚清楚。我们前期研究发现：人类新发冠状病毒SARS病毒和NL63病毒木瓜样蛋白酶(PLP)具有去泛素化酶(DUB)活性,而且是一种宿主干扰素拮抗剂。为了证实DUB活性和对宿主干扰素拮抗特性是所有冠状病毒木瓜样蛋白酶都具有的生物学特性,本研究以动物冠状病毒-猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)作为研究对象。研究发现PEDV感染宿主后不诱导IFN-p产生并且负调节IFN-p表达,同时PEDV抑制核转录因子IRF3活化通路；推测PEDV可能是通过抑制IRF3通路从而负调节宿主抗病毒干扰素表达通路。PEDV非结构蛋白nsp3编码两个木瓜样蛋白酶(PLP)PLP1和PLP2结构域,进一步研究发现,PEDV PLP1不具有DUB活性,对干扰素也无拮抗作用；PLP2是PEDV编码的去泛素化酶(DUB),PLP2对K48和K63连接的多聚泛素化修饰均具有DUB活性,说明PLP2DUB活性对K48和K63连接的多聚泛素化无底物特异性。同时,将PLP2的蛋白酶催化活性位点C1729、H1888和D1901突变,突变后PLP2DUB活性明显被抑制,说明PLP2蛋白酶催化活性位点同时也是其DUB活性关键位点。此外,PLP2对仙台病毒激活的IFN-β表达具有明显抑制作用,说明PLP2是PEDV编码的一种干扰素拮抗剂,而且其干扰素拮抗功能与其蛋白酶催化活性密切相关。以上研究提示,PLP2能够负调节干扰素表达通路。那么PLP2是如何对宿主抗病毒干扰素表达通路进行调节?研究发现,PLP2抑制RIG-Ⅰ激活的IFN-β、NF-κB和IRF3通路,并且抑制STING激活的IFN-p和IRF3通路。进一步研究其机制发现,PLP2能够与宿主抗病毒天然免疫系统中的重要模式识别受体(PRR) RIG-I以及重要调节蛋白STING发生相互作用,通过对RIG-Ⅰ和STING的去泛素化负调节宿主抗病毒天然免疫反应。以上研究为阐明PEDV对宿主抗病毒天然免疫反应的调节作用和其致病机制提供了重要的理论依据,为开展PEDV新的免疫防治措施提供了重要理论基础。