丹顶鹤（Grus japonensis）属鹤形目、鹤科的大型涉禽,为国家Ⅰ级保护动物,是受国内外专家学者关注的珍稀野生动物资源。由于生态环境的改变、湿地的减少,使丹顶鹤赖以生存的栖息地日益丧失,导致丹顶鹤种群数量连年下降。当前丹顶鹤的保护工作已引起全世界的普遍关注。2007年4月在扎龙国家级自然保护区,采用瞬时扫描取样法对散养和野生丹顶鹤的孵卵期行为进行了观察。对动物个体各行为型发生频次进行了行为差异的显著性比较。利用扩增片段长度多态性（AFLP）初步建立了用于丹顶鹤遗传标记的新体系,筛选出28对选择性扩增引物,对5对丹顶鹤进行了多态性和亲缘关系分析,探讨了AFLP分子标记技术应用于丹顶鹤研究的可行性。为AFLP分子标记技术应用于丹顶鹤的亲缘关系鉴定提供了新方法,开辟了国内外对丹顶鹤行为遗传学研究的新途径。结果表明:1.散养丹顶鹤与野生丹顶鹤的孵卵期行为模式基本相同。在总体行为发生频次上,散养丹顶鹤的繁殖行为明显高于野生丹顶鹤,游走行为则低于野生丹顶鹤。行为日节律的比较表明,一天中各时间散养丹顶鹤的繁殖行为波动小于野生丹顶鹤。由于人为干扰,散养丹顶鹤的繁殖行为显著高于野生丹顶鹤的繁殖行为（P＜0.05）。在个体间差异比较中,散养丹顶鹤与野生丹顶鹤在觅食表达上均存在显著差异（P＜0.05）,而散养丹顶鹤的警戒行为表达也存在显著差异（P＜0.05）。2.丹顶鹤孵卵期的行为差异与其筑巢地点受干扰程度有很大关系,人为干扰是影响其行为的重要因素。散养鹤对人的存在并不敏感,使其在各行为的表达上与野生鹤有一定区别。人为干扰对野生鹤的繁殖行为有很大影响。3.利用28对引物对5对丹顶鹤进行了多态性和亲缘关系分析,共得到1114个扩增位点,其中多态性条带551条,多态性比例为49.5%。表明AFLP技术应用于丹顶鹤基因组分析可获得良好的效果。4.对AFLP数据进行聚类分析,构建了5对丹顶鹤的UPGMA聚类图,1、2号和3、4号鹤的亲缘关系较近,其余3对鹤亲缘关系较远。