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研究栽培稻抽穗期多样性的形成及进化机制,对揭示栽培稻区域适应性、扩大种植范围具有重要的指导意义。前人研究表明栽培稻长日抑制基因对抽穗期多样性具有重要影响,但目前仍未完全明确分子遗传变异及适应性机制。本研究拟以148份栽培稻及野生近缘种为实验材料,对8个长日照开花抑制基因DTH8、Ghd7、Hd1、OsPRR37、PhyB、Os COL4、Hd6和Se5进行测序,研究其变异位点与栽培稻抽穗期多样性的相关性,检测变异位点在栽培稻驯化过程中的选择信号和连锁关系,揭示基因单倍型的遗传关系及其分子进化形式。结果如下:1.8个基因中,除Hd6和Se5外,其它基因在野生稻和栽培稻群体中都有较高的核苷酸多态性,变异位点数从20(OSCOL4)到70(Hd1),且野生稻群体的多样性明显高于栽培稻的2个亚群(籼稻和粳稻)。其中,DTH8、Ghd7、Hd1、PhyB在野生稻群体有相对较高的多样性,且是籼稻群体和粳稻群体的2倍或者2倍以上。2.DTH8、Hd1和OsPRR37分别有14、2和3个变异位点与抽穗期的多样性显著相关,且DTH8的3个显著相关的变异位点和Hd1的2个显著相关位点的变异均是由于碱基缺失,其中DTH8的1个变异位点的碱基缺失造成相应等位基因的功能缺失。3.各基因的栽培稻单倍型主要位于Network图的顶端,其中DTH8、Ghd7、Hd1、Phy B的籼稻和粳稻的单倍型分布比较集中,且这4个基因的籼稻单倍型和粳稻单倍型具有不同的地理分布格局。4.连锁不平衡结果显示,DTH8、Ghd7、Hd1、OsPRR37、Phy B、OsCOL4基因内的大部分变异位点具有连锁关系。在基因之间,DTH8、Ghd7和PhyB之间大部分变异位点显著连锁。本研究结果说明,发生插入缺失或者功能缺失的等位基因对栽培稻抽穗期的多样性可能发挥重要作用。在这8个基因中,DTH8、Ghd7、Hd1、Phy B基因在栽培稻的驯化过程中有明显的选择信号,随着栽培稻种植区域的扩大,进化出适应不同地域特有的等位基因。另外,DTH8、Ghd7以及Phy B基因之间显著连锁,这3个基因在驯化过程中可能是协同进化的,从而影响开花时间的多样性及对不同地区的区域适应性。