我国是世界上水资源最贫乏的13个国家之一，由于水资源在时间和空间上分配不均，季节性和区域性水资源短缺常常发生。随着人口的增加和经济社会的发展，人们对水资源的需求量愈来愈大，经济发展伴随着水土流失和水污染日趋严重，又使水资源利用率下降甚至无法利用，进一步加剧了水资源的供求矛盾。水资源如此稀缺，人们对其需求又日趋增大，如何选择水资源配置模式进行水资源优化配置自然已成为我国学术界乃至全社会关注的热点领域。 水资源产生、运动、循环、再生有其自然规律，流域是水资源运行的基本单元，因此本文选择了将流域水资源配置作为研究对象。论文通过对中国水资源基本情况的分析，系统地逐一展开对计划主导型、商品主导型、生态主导型等水资源配置模式的机理进行分析、研究，揭示了各种配置模式优势和局限，在此基础上提出一个融合规划、交易、调度、制度安排等多种手段的具有激励相容特征的现代市场主导型配置模式才是我国未来流域水资源配置应该倡导的可持续发展模式。 本文先对我国实行了几十年的计划主导型水资源配置模式进行分析，剖析了水资源配置中的利益主体和利益机制，揭示出这种模式的主要特点是中央计划部门依靠指令性计划手段直接在宏观和微观两个层面进行水资源配置，水资源基本无偿使用，这种配置的结果是水资源的动态相对稀缺性得不到反映，导致利用的低效率和严重浪费。其根源在于：一是否定了微观经济主体独立的经济利益，使得利益机制扭曲而导致信息失真。二是计划制定所需要的大量的信息，从最终消费者传递到中央计划部门的过程中，须经过大量中间层级的筛选、加工，最后得到的信息与原始信息比较已经发生严重扭曲；同时计划下达到微观主体那里又具有较长的时滞。这种信息严重失真和时滞及无偿使用使得水资源配置整体上出现低效率、误配置。 随着计划主导型配置模式被人们摈弃，商品交易(即有偿使用)配置方式引起了普遍重视。这类水资源配置模式主要利用价格机制配置水资源。价格机制具有反映资源动态相对稀缺性信息、提供内在激励和决定利益主体之间收益分配等功能，正是这些功能使水资源配置中宏观利益主体与微观利益主体之间以及后者相互之间的利益得到了协调，水资源从低效率用途开始转向高效率用途。市场这只“无形之手”开始使水资源供给与需求之间达到良性互动状态，水资源配置效率得以提高。 但是，商品主导型配置在提高水资源利用效率的同时仍存在着令市场失灵的局限，因此论文接着分析了生态主导型配置模式。由于流域水资源本身的特点，水资源利用中具有较强的外部性和垄断特性，同时流域生态水具有公共产品属性而无法单纯利用市场机制高效率配置。现代经济学认为依靠政府进行适当干预可以矫正市场失灵，而在流域水资源配置中政府可通过提供“顺市场”的“调度”来矫正水资源配置中市场失灵。但是由于政府和消费者存在“短视”行为，在矫正市场失灵中又往往具有相当的局限性，包括由交易费用高昂与激励不足导致的生态补偿缺位，使得生态水等公共物品动态供给不足，出现配置低效率。 最后，本文研究提出了以激励相容制度安排为特征的现代市场主导型水资源配置模式。这类模式不仅以市场机制作为水资源配置的基础方式，而且还兼容了规划、调度等手段；不仅重视了水资源的商品性，而且还强调了全社会的生态目标；更重要的是该模式注重了激励相容的制度设计，因而是一种交易费用较低的流域水资源配置模式。论文在分析了自然、经济、社会三方面条件约束后，论文认为全社会不仅要追求当代人的利益，而且也应追求子孙后代的利益，微观利益主体不仅有企业，而且也包括各级地方政府。在此分析的基础上，提出了宏观、中观、微观三个层次的制度安排才能保障时间维度上代际激励相容，空间维度上个体与个体、个体与总体的激励相容。因此，激励相容型现代市场配置最终可达到宏观与微观、局部与全局、当代与后代的利益协调和交易费用的下降，最终通过“政政”、“政企”、“企企”之间，也即人与人之间的和谐来达到人与自然间的和谐，从而使中国流域水资源的配置得到优化。