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目的：研究中国男性孤立性低促性腺激素性性腺功能减退症(isolated hypogonaditropic hypogonadism,IHH)患者的临床特征和致病基因表达谱,探究基因型、表型和临床转归之间的关系,并鉴定新的IHH致病基因. 方法：本研究设计了包含83个基因的基因panel,其中包含31个已知的IHH的致病基因和52个候选基因.通过靶向的二代测序技术对男性IHH患者进行目标区域的深度测序.通过Sanger测序、高通量芯片和生物信息学分析筛选可疑的致病突变.并通过体外功能实验,验证基因突变的致病性. 结果：本研究中,完成153例男性IHH患者的83个基因的测序和分析工作.其中KS患者77例,nIHH患者74例和AIHH患者2例.通过生物信息学分析,在52个基因中筛选出了基因突变,其中已知致病基因中有16个基因(51.61%)发现了突变,未知基因中有36个候选基因(69.23%)发现了突变.在16个已知的致病基因中,发现了6个新发的致病突变和52个可能致病的突变.在153名男性IHH患者中,已知的IHH致病基因中突变频率较高的是PROKR2、CHD7、FGFR1、ANOS1.同时,有13名患者(8.50%)至少携带2个基因突变.此外,在候选基因中,RELN,PLXNB1,SEMA4D,SEMA7A,ERBB4和EGFR应该优先进行进一步研究.在153名男性IHH患者中,有17名患者伴有单侧或双侧隐睾,但是未发现隐睾与某种基因有特定的关系.在体外功能实验中,发现剪接位点突变:FGFR1,c.1430+1G>T,导致了FGFR1mRNA基因的异常剪接.7个FGFR1基因的错义突变(p.Gly685Arg、p.Ala606Asp、p.Gly224Asp、p.Arg209Cys、p.Gly97Arg、p.Val71Met、p.Gly70Arg),为功能缺失突变.在一典型的Kallmann综合征家系中,在X染色体上发现新发的拷贝数变异(CNV),缺失大小约为0.24Mb,并确定了断裂点的位置(chrX:8536480~chrX:8730416).该缺失包含ANOS1和FAM9A基因,并影响了ANOS1基因的表达. 结论：本研究描述中国男性IHH患者的临床特征和已知致病基因的突变频率,发现了FGFR1基因和ANOS1基因新的致病突变,扩展了IHH致病基因表达谱.同时,应该进一步研究RELN,PLXNB1,SEMA4D,SEMA7A,ERBB4和EGFR的功能,以及与IHH的关系.此外,本研究还提供了高效、可行的遗传性疾病的研究策略。