城镇化是当代各国经济社会发展的一种必然过程，但城镇化在推进城市经济发展和社会全面进步的同时，也会给广大失地农民的生产和生活带来前所未的冲击和影响。可以在一定程度上说，失地农民权益保障问题随着城镇化的加快发展而日益突出，已成为影响我国城乡统筹发展和社会和谐稳定的重要因素。本文从对失地农民权益保障问题的理论分析着手，分析了我国城镇化进程中失地农民权益保障存在的问题及其主要影响因素。在对失地农民权益流失进行理论分析时，笔者主要运用到了制度经济学理论和阿马蒂亚·森的可行能力理论和博弈论等理论方法。笔者首先基于制度经济学分析框架，对失地农民的权益流失进行了分析。为了客观地分析失地农民权益流失，我们从失地农民权益的制度合理性流失和制度缺失性流失两大层面进行了具体分析。如果说基于制度经济学分析框架来探讨失地农民的权益流失是从外因视角来研究其成因，那么基于森的可行能力理论分析框架则是从失地农民本身的内在因素来探讨问题的根源。在利用阿马蒂亚·森的可行能力理论对失地农民权益流失进行分析之后，我们还利用产权理论探讨了约束农民土地发展权的相关原因。在指出城镇化进程中失地农民权益保障存在几个主要问题的同时，笔者还运用了博弈论等基本理论方法深入探析了失地农民权益保障缺失的成因。为了将理论分析与实证分析相结合，笔者以株洲市失地农民权益保障问题研究为例，深入分析了征地拆迁过程中失地农民的权益保障缺失之所在，而这主要是从以下三个方面展开分析的，即以征地拆迁补偿制度为例分析调查失地农民权益保障问题、征地拆迁实际情况分析和失地农民特征分析。通过对我国城镇化进程中失地农民权益缺失的理论和实证分析，本文还提出了失地农民权益补偿的理论基础及其思路，并从完善现行的征地制度、改革农地产权制度、创新农地流转制度和建立失地农民的社会保障制度等四个方面给出了相应的对策建议。