基于16S rDNA的基因测序在腹透相关腹膜炎早期诊断中的应用

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研究背景:腹膜透析(peritoneal dialysis,以下简称PD)是终末期肾病(end-stage renal disease, ESRD)的主要肾脏替代治疗方法之一。腹透相关腹膜炎是腹膜透析最常见的感染性并发症,严重者可引起腹透技术失败,甚至死亡。细菌学培养是腹透相关腹膜炎诊断的可靠依据。然而,传统的细菌培养有周期长、阳性率偏低、易受抗生素使用影响等不足。因此,寻找能快速、有效鉴定菌种的新方法具有重要意义。近年来,以16S rDNA为基础的分子生物学技术因快速、灵敏、准确等优点在各类疾病的菌种鉴定中尤受青睐。16S rDNA是原核生物核糖体中16S rRNA对应的基因序列,既有高度保守性,又具有一定变异性。利用保守区域设计通用引物或特异探针,再利用可变区的差异鉴别菌种,这就是此类分子生物技术的基本原理。研究目的:探讨基于16S rDNA的基因测序在腹透相关腹膜炎早期诊断中的临床应用价值。实验方法:本研究选取69例腹透相关腹膜炎的腹膜透析透出液标本作为研究对象,选取16S rDNA保守区的通用引物27F/1492R进行PCR扩增,对扩增所得的目的基因进行测序及序列比对确定细菌,最后与常规培养法相比较。此外,取18例腹透病人的正常腹膜透析透出液作为对照组,予上述测序方法及常规培养鉴定有无细菌。结果:在69例腹透相关腹膜炎的腹膜透析透出液标本中,测序法鉴定病原菌的阳性率(71%,49/69)虽然高于常规培养法(63.8%,44/69),但未达统计学显著性差异(P>0.05)。在44例培养阳性的标本中,测序法的一致性为72.7%(32/44)。在25例培养阴性的标本中,测序法鉴定出8例菌株,追踪病史可知其中3例患者在前一次/后一次腹膜炎感染时常规培养证实有相同的病原菌感染,剩余5例患者有培养阴性的腹膜炎记录或未再发生腹膜炎。在有近期抗生素使用史的18例标本中,测序法的阳性率(61.1%、11/18)高于常规培养法(50%,9/18),但未达统计学显著性差异(P>0.05)。作为对照组的18例腹膜透析透出液经测序法和细菌培养法,均无阳性结果。结论:基于16S rDNA的测序法的阳性率高于常规培养法,虽未达到明显统计学差异,但测序法具有耗时短、花费少、操作简单、不受抗生素影响等优点,可作为常规病原学培养的有益补充,具有早期、快速诊断腹透相关腹膜炎的重要的临床应用价值。
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