非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）是单链的核糖核酸,由DNA转录形成却不编码产生蛋白质。早已为人们所知的如转运RNA,核糖体RNA等,还有一些发现较晚的非编码RNA,如微小RNA（miRNA）、核仁小RNA（small nucleolar RNA, snoRNA）和小核RNA （small nuclear RNA,snRNA）等。已有的研究发现,非编码RNA在生物体内发挥着重要作用：调控基因表达,参与RNA的剪切和修饰等。而现阶段,研究非编码RNA的重要手段之一就是高通量测序技术。人们研究非编码RNA通常以一种特定的非编码RNA为研究点进行分析,本实验主要想通过高通量测序,研究在100-200nt内的所有的非编码RNA。实验样本为人类,猩猩,猕猴和老鼠的大脑组织。实验创新点是以Illumina公司的标准建库方案为雏形,结合实验的研究目的,成功的探索出100-200nt非编码RNA cDNA文库的建立方法,并用Hiseq测序仪对文库进行高通量测序。最后,对测序数据进行了分析。通过序列比对,注释信息的获得,及注释信息与所找到的高表达候选区域的比较,最后通过INFERNAL算法对候选区域进行筛选,我们在4个物种内共发现了59个新非编码RNA,其中大量表达（序列>50条）的有20多个,保守性较高的有4个。新的非编码RNA的发现对现有的非编码RNA库的一个补充,为接下来的实验打下基础。并且我们进行一些家族的同源基因的比较,发现如人的SNORA29,它在其他物种有表达,但在人类却没有表达,这种特殊的基因可以作为下面继续研究的关注点。