最新数据显示,胃癌已经成为癌症死亡的第四大主要原因,手术切除、放疗、化疗等常规的胃癌治疗方法,患者治愈率低,其五年生存率也低,治疗缺乏针对性。因而从分子水平上寻找与胃癌发生发展相关的基因,即本文提到的驱动基因,为胃癌的早期诊断提供生物标志物以及为中晚期胃癌的靶向治疗提供有效靶点显得尤为重要。本文运用生物信息学的方法,通过整合分析来自不同地域胃腺癌样本的基因表达数据、DNA拷贝数变异数据以及miRNA数据,意在挖掘出其中与胃癌的发生发展密切相关的驱动基因。以往的大多数研究要么是对单一基因组数据进行分组分析,要么是对多类型的基因组数据进行不分组的整合分析,得到的差异基因往往较多,缺乏针对性,难以为胃癌的靶向治疗提供精准的靶点。本文则是在即分组,又整合多类型的基因组数据前提下,精准挖掘可能与胃癌发生发展相关的基因。首先,本文对从TCGA官网获取的亚洲人和白种人的基因表达数据和DNA拷贝数变异数据进行整合分析,筛选出两组数据样本中共有的差异表达基因,并对其进行基因功能富集分析和通路分析,再将其导入String数据库建立蛋白互作网络,并从该网络中筛选出两个重要的子网络。最后从子网络中筛选得到49可能与胃腺癌发生发展相关的驱动基因,这些基因的表达量与基因拷贝数呈正相关。其次,本文利用miRDB数据库预测两组胃腺癌miRNNA数据样本中共有的差异表达miRNA的靶基因,并与那些基因表达量和基因拷贝数呈正相关的基因相整合,建立miRNA-靶基因调控网络。对调控网络中的靶基因进行基因功能富集分析和通路分析,从中筛选出36个可能与胃腺癌的发生发展相关的基因。除去与之前所得到的49个基因中重复出现的,本文共挖掘到77个可能与胃腺癌发生发展相关的驱动基因。已有研究显示,其中的24个基因确与胃癌的发生发展相关,剩下的53个基因可能是在亚洲人和白种人胃癌的发生发展过程中起着重要作用的特异性驱动基因,这些驱动基因可以为亚洲人和白种人的早期诊断以及中后期的靶向治疗提供新的参考依据。本文的研究方法为寻找胃癌的早期诊断生物标志物和靶向治疗基因提供了新的思路。