新型农村合作经济组织在提高农民社会地位，增加农民收入，缓解社会矛盾，维护社会稳定等方面作用突出；其所倡导的民主合作思想，不仅有助于推动农村的民主化进程，而且有助于政府部门的职能转变和领导方式变革。随着我国“创新社会管理”理念的提出，农村合作经济组织作为解决三农问题的重要非政府组织，重新进入研究者的视野，本文就是在这样的大背景下对其进行的研究探讨。本文从合作经济组织的发展现状入手，重点通过分析其组织结构——治理结构和管理结构，发现限制其发展的障碍因素。在治理结构方面，组织受外界影响颇深，主要表现在与政府之间的关系和为融资而受到外部力量如厂商、外部商会的介入，进而影响其独立性和保障农民权益的问题。在管理结构方面，一是组织制度不健全，组织章程、财务制度、监事制度、人员升迁奖惩制度以及反馈制度不完善甚至短缺，且相互之间缺少监督、配合，致使章程变为一纸空文；二是管理水平有限，管理者知识水平不高，会员民主参与意识不高；三是组织机构缺少财务、监督机构；四是组织机制不完善，决策机制不能充分调动社员积极性，利益分配机制混乱进一步加大管理危机。本文采用比较分析法，旨在从农村合作经济组织发展历史已久且取得成功经验的欧美发达国家获取相关经验，进而联系本土实际，提供一些切实可行的发展思路。在政府宏观管理上，首先，借鉴西方经验用立法的形式保障合作经济组织的地位、规范权责、以及明确政府管理部门，防止多头领导、交叉地和真空地的出现；其次，提出政府在财政方面给予相关支持，以保证合作经济组织的独立性。在内部管理方面，会员资格审查制度、利润分配返还制度以及相应财务制度的构建都会为提高合作经济组织地位、发挥起作用、提高农民的参与意识等方面起到积极作用。