以吉林省露水河林业局宏伟种子园无性系种子园家系及其自由授粉子代为研究对象,分析了其遗传多样性和交配系统,并进行了父本分析。通过改良的CTAB法提取红松针叶DNA,并建立了稳定的红松SSR体系,满足红松PCR的需要。并从78对引物中筛选出13个多态性较高的SSR引物,共扩增出56条带,平均每个引物4.2条。对100个子代进行了父本分析。结果表明,所有候选亲本的总的繁殖适合度约为53%。在150个候选亲本中,按照95%的置信区间,有48个(占32%)为子代群体提供了有效花粉。其中,亲本10和96的雄性繁殖适合度最大,为3%。其余亲本的雄性繁殖适合度在1%-2%之间,平均为1.34%;另有102个(68%)候选父本没有为子代群体提供有效花粉,其雄性繁殖适合度为0。花粉传播并不是均匀分布的,在已确定的53个自由授粉子代中,距离15-30m和30-45m的个体间的交配比例均最高,分别占36%和30%,平均交配距离为32.6m;最大交配距离达67.88m。建园无性系群体具有较高水平的遗传多样性。建园无性系的基因多样度(PIG)值为0.5333,同马尾松等树种的天然林群体相近;群体的平均观测杂合度Ho为0.6481,平均期望杂合度He为0.6005,观测杂合度偏高;子代群体同种子园无性系(亲代)相比,各项多样性参数相近,遗传多样性并没有降低。Fit值为-0.0517,表明子代群体接近Hardy-Weinberg平衡,推测可能同种子园无性系间的随机交配有关。通过对种子园进行交配系统分析,得出多位点异交率为tm=0.823,单位点异交率ts=0.785,近交指数tm-ts=-0.062,固定指数F=0.375。种子园异交率比较高,近交指数很低,种子园内近交不显著。