【摘 要】
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蛋白质结构分类分为多个层次,如何对蛋白质结构进行定量分类和自动分析是目前研究的重点。本文选择蛋白质二级结构数据为主要的研究对象,应用数据挖掘技术和机器学习中的动态
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蛋白质结构分类分为多个层次,如何对蛋白质结构进行定量分类和自动分析是目前研究的重点。本文选择蛋白质二级结构数据为主要的研究对象,应用数据挖掘技术和机器学习中的动态规划理论进行蛋白质结构分类。介绍一种新的蛋白质结构分类方法——PSSC,该方法的核心算法是STRIDE算法和ISSA算法,核心步骤是创建分类模型。该分类模型包括构建CATH分类树、计算蛋白质结构相似度、利用统计方法制定分类标准三步。在对蛋白质结构进行四个层次的分类中,应用已有的RMBS、Z-Score结构比对算法和本文新提出的ISSA结构比对算法获得分类参数。最后,介绍自行开发的PSSC分类科学计算软件,并指出需要完善之处和解决方案。
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