饲喂瘦肉精猪肌肉microRNA的表达差异及靶基因预测

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microRNAs (miRNAs)是一类长为22nt左右的非编码RNA分子,对生物体的生理功能具有广泛的内源性调节作用。miRNA功能探索和表达分析在模式生物中迅速地进行,miRNA的研究已成为当前生物学领域的热点问题,它们不但在胚胎发育时期表达,在成体中也存在不同的表达情况。盐酸克伦特罗作为β-兴奋剂的一种,在用于改善猪肉品质时有害于人的健康,间接或直接影响到了一些基因从而很大程度上提高了瘦肉率、降低了脂肪率,因此我们用盐酸克伦特罗处理的香猪肌肉组织研究几种microRNA的差异表达并期望与靶基因建立联系。本实验首先运用northern bolt方法证明猪骨骼肌中存在miR-1、miR-133、miR-206、miR-29a、miR-29b、miR-181a、miR-193、miR-195、miR-196a、let-7a、let-7b、miR-26a、miR-30d等13类microRNAs,其中miR-1、miR-133、miR-206的杂交条带明显,miR-181a、miR-193、miR-195等杂交条带很微弱;然后利用real-time PCR方法检测这几种microRNA在骨骼肌组织中的表达情况,结果发现:1 miR-1、miR-133、miR-206的表达量远高于其他的microRNAs,但是在实验组和对照组之间表达没有差异。2 let-7a、miR-26a在实验组和对照组之间表达差异不明显,但是都表现出随个体月龄增长表达下降的趋势。3 miR-181a、miR-193、miR-195、miR-196a、miR-30d、let-7b的表达不具有明显的规律性。4 miR-29a、miR-29b在实验组和对照组之间表达差异显著,且呈相反的规律,即个体中miR-29a、miR-29b的表达情况恰好相反。5根据基因芯片的结果,整理出在盐酸克伦特罗的作用下香猪肌肉组织中表达差异的基因,在这些基因中预测上述microRNA可能存在的靶位点:1)非表达差异的microRNA可以在这些基因上预测到靶位点;2)表达差异的miR-29a、miR-29b的靶位点有Integrin-linked kinase、Elongation factor 1 alpha、MHC class I antigen、SWI/SNF complex、HnRNP F protein等,可以分析microRNA和靶基因二者对盐酸克伦特罗处理的肌肉组织表型的影响。
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