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本论文根据蛋白酶数据库MEROPS已作的蛋白酶家族氨基酸联配图,从丝氨酸蛋白酶S8家族中选择具有代表性的枯草杆菌类蛋白酶,从GenBank中获取相应的DNA序列,设计并合成了10条引物。
从自然界先后采集了21份样品,使用脱脂牛奶平板富集所有的胞外蛋白酶产生菌,将它们混合培养并提取了12个总DNA。用6对引物在降落PCR(Touchdown PCR,TD-PCR)条件下对12个总DNA样品分别进行了蛋白酶编码序列的扩增,获得47个片段。选取19个800-1200bp长的扩增片段进行测序,测序结果及同源性分析显示:8个为蛋白酶DNA片段;3个能在数据库找到同源但非蛋白酶基因序列;其余8个在数据库中没有找到同源基因。对8个蛋白酶片段编码序列的进一步分析发现,它们实际上是4种不同的蛋白酶DNA序列。其中有同1对引物扩增得到的DNA序列差异性达到32%,说明使用PCR方法从混合菌中获得新蛋白酶基因是可行的。
克隆到的蛋白酶DNA片段G2与碱性蛋白酶E(GenBankNo.:AJ539133)的编码区几乎相同,与其他蛋白酶DNA序列最多有94%的相似性,至少有20个氨基酸的差异,目前尚没有人对其产物的性质进行具体的研究。将它插入大肠杆菌表达载体pTWIN1,获得的重组质粒在大肠杆菌ER2566中进行表达。