【摘 要】
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近年来基因相关的研究备受关注。临床医学和生物实验产生海量的生物数据,目前有很多数据库都记录了基因和疾病的本体数据,但大部分数据库专一性较强,无法有效根据不同基因的关联关系发现基因潜在信息。本课题融合多个基因相关的数据源,使用改进的随机游走算法,研究并开发了基因集成资源搜索系统,并利用系统中多数据源融合的集成资源进行基因数据挖掘,发现基因的潜在功能。实验结果表明,本文提出的方法在融合了多个数据源之后
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近年来基因相关的研究备受关注。临床医学和生物实验产生海量的生物数据,目前有很多数据库都记录了基因和疾病的本体数据,但大部分数据库专一性较强,无法有效根据不同基因的关联关系发现基因潜在信息。本课题融合多个基因相关的数据源,使用改进的随机游走算法,研究并开发了基因集成资源搜索系统,并利用系统中多数据源融合的集成资源进行基因数据挖掘,发现基因的潜在功能。实验结果表明,本文提出的方法在融合了多个数据源之后,仍取得了较好的预测结果。论文的主要工作如下:1.本文结合基因本体、疾病本体、人类表型本体等多个生物数据库资源,通过计算基因之间的相似度和术语之间的相似度构建一个基因-术语关联网络,并把构建的关联网络进行可视化显示;2.提出一种基于多数据源融合的加权有偏随机游走算法来预测基因功能。基于基因-术语关联网络,利用有偏随机游走算法发掘网络的结构信息进行基因功能预测;3.开发了基于多数据源融合的基因集成资源搜索系统。该系统将多个数据库中的相关数据进行融合,为多个数据库的访问提供统一入口,加快了不同基因检索的速度,同时搜索的结果可以使用不同的视图进行展示。
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