贲门癌是我国较常见的消化道恶性肿瘤，由于早期诊断困难，预后极差；而基础研究表明：肿瘤的发生是由于各种原因所致的体细胞基因突变及其积累的结果。因此，分离、克隆与贲门癌发生、发展高度相关的基因或基因片段将对贲门癌的早期诊断、预后评价及其治疗具有重要的临床指导意义。 本研究中，我们采用先进的AP-PCR技术及其相关的分子生物学方法，通过对50例配对的贲门癌及其相应正常组织的基因组DNA指纹图之间差异条带的分析，从中分离并克隆了三个贲门癌组织缺失的差异基因片段，分别命名为X、Y、Z。测序结果表明：差异片段X、Y、Z的大小分别为449bp、316bp、323bp；同源序列比较发现：X、Z片段无与之高度同源的序列，可能来自未知基因；Y片段与美国贝勒医学院新近发现的人脑组织中的一段cDNA序列具有98％的同源性，是一基因的功能片段。本实验所获得的三个差异片段均是首次被发现在贲门癌组织中发生了缺失，推测可能是新的贲门癌相关缺失基因片段，该三个差异片段的DNA序列已被NCBI的GenBank数据库收录并登记(登记号分别是：AF052615，AF052616，AF052617)。 为了进一步了解本实验所克隆的差异片段在贲门癌及其癌旁组织中的缺失频率，我们对本组50对贲门癌手术切除样本进行了PCR检测，结果发现：X、Y片段在贲门癌及其癌旁组织中的缺失频率分别为66％、18％及34％、4％；我们将本组病例的检测结果与其相应的临床病