线粒体DNA C1494T突变分子流行病学调查及线粒体tRNA与耳聋关系的研究

来源 :温州医学院 温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pengweimin
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目的:   1.开展浙江省耳聋分子流行病学调查,完善非综合征型耳聋资源数据库,并进行聋病分子机制研究。   2.对温州、宁波两地门诊的非综合征型耳聋患者人群进行线粒体DNAC1494T突变检测,估算C1494T突变的发生频率,完善省内药物性耳聋监控系统。   3.采集携带线粒体DNAC1494T突变的耳聋家系,分析分子这些家系的遗传特点,深入探讨母系遗传药物性耳聋的分子致病机制。   4.筛查与非综合征型耳聋相关的线粒体tRNALu(UUR)、tRNAIle和tRNALys基因突变,初步探讨线粒体tRNA基因突变与耳聋的关系。   方法:   1.拟定耳聋分子流行病学调查工作程序,完善浙江省耳聋遗传资源采集网络,以省内各地聋哑学校及门诊的聋病资源为中心,采集耳聋患者的临床、家系资料和血液样本。   2.以温州、宁波两地非综合征型耳聋患者为研究对象,采用常规PCR扩增、测序技术和本实验室自主研发的《用于同时检测线粒体DNAA1555G和C1494T突变的试剂盒》,进行线粒体DNAC1494T突变检测,计算突变频率。   3.完善线粒体DNAC1494T突变携带者及其家属的临床和遗传资料,进行详细的听力学检测、系谱分析、线粒体基因组全序列分析,评估氨基糖甙类药物、单体型、继发突变、核基因对C1494T突变表型表达的影响。   4.以温州地区聋哑学校及门诊病例为研究对象,采用常规PCR扩增和测序技术进行线粒体tRNALeu(UUR)、tRNAIle和tRNALys基因突变筛查。对新突变位点进行保守性分析、二级及高级结构预测等,评估这些突变位点与聋病相关性。   结果:   1.2008年4月-2011年3月,我们在温州、宁波两地共收集门诊病例521例。迄今本人所在研究团队所建立的耳聋遗传资源库,共有2163例非综合征型耳聋样本,其中1542例来自全省10个地市聋哑学校,621例来自温州、宁波两地医院门诊。   2.通过温州、宁波两地621例非综合征型耳聋患者线粒体DNAC1494T突变的检测,我们发现了两例突变携带者,检出率为(突变携带者/患者总数)0.32%。药物性耳聋患者占调查总数的16.46%,线粒体DNAC1494T突变携带者占药物性耳聋患者的1.94%。   3.对两个携带线粒体DNAC1494T突变的氨基糖甙类药物性非综合征型耳聋家系(NB133、FE247)进行临床数据统计和分子遗传学分析,两个家系NB133和FE247的耳聋外显率(母系成员耳聋患者/所有母系成员)分别为33.3%和11.1%,平均值为22.2%,非药物性耳聋的外显率(非药物性聋患者/所有母系成员)则分别为11.1%和5.6%,平均值为8.3%。先证者的线粒体全序列分析表明,两个线粒体基因组分别属于东亚人群C4a1a和B4b1c单体型。NB133家系同时携带了C1494T和G7444A突变,但其外显率与其他已报道家系并无显著性差异。核基因GJB2的突变检测结果显示,两位先证者均不携带与耳聋相关的致病突变位点。   4.采集温州地区222例非综合征型耳聋样本进行线粒体tRNALeu(UUR)、tRNAIle和tRNALys基因突变筛查,在五个耳聋患者中发现四个不同的变异位点:tRNALeu(UUR)T3290C,tRNAIleA4317G,tRNALysA8343G和C8346A突变,这四个变异位点均位于tRNA的TψC环上。其中,3290和8343位点为多态性位点。保守性分析表明,tRNAIle4317位点的保守系数高达85.7%,其次是tRNALys8346位点。目前尚未见tRNALysC8346A突变与疾病相关的报道。   结论:   1.线粒体DNAC1494T突变在温州、宁波两地621例非综合征型耳聋患者中的检出率为0.32%,占药物性耳聋人数的1.94%。   2.在两个携带线粒体DNAC1494T突变的氨基糖甙类药物性非综合征型耳聋家系中,氨基糖甙类药物增强了C1494T突变的耳聋表型表达,线粒体单体型、线粒体DNA7444G>A突变、GJB2基因对C1494T突变的修饰作用不明显。   3.在温州地区222例非综合征型耳聋样本的线粒体tRNALeu(UUR)、tRNAIle和tRNALys基因突变筛查中,发现四个变异位点:tRNALeu(UUR)T3290C,tRNAIleA4317G,tRNALysA8343G和C8346A,其中,tRNAIleA4317G和tRNALysA8343G突变可能与非综合征型耳聋相关。
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