【摘 要】
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青头潜鸭（Aythya baeri）成年个体的数量已不足1000只,其种群数量受到严重威胁,是世界最濒危的鸟类之一。主要组织相容性复合体（Major histocompatibility complex,MHC）是脊椎动物最具多态性的基因家族之一,在对病原体的免疫防御中发挥重要作用,其能反应一个物种对环境的适应能力。为了调查维持青头潜鸭、斑背潜鸭、凤头潜鸭和红头潜鸭MHC I类基因多态性的机制,我
【基金项目】
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国家自然科学基金（31872242,32070405,31900311,32000291和32001228）；
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青头潜鸭（Aythya baeri）成年个体的数量已不足1000只,其种群数量受到严重威胁,是世界最濒危的鸟类之一。主要组织相容性复合体（Major histocompatibility complex,MHC）是脊椎动物最具多态性的基因家族之一,在对病原体的免疫防御中发挥重要作用,其能反应一个物种对环境的适应能力。为了调查维持青头潜鸭、斑背潜鸭、凤头潜鸭和红头潜鸭MHC I类基因多态性的机制,我们对9个青头潜鸭,9个斑背潜鸭,8个凤头潜鸭和10个红头潜鸭共36个潜鸭属个体的MHC I类基因进行测序,在对720个克隆子进行比对筛选后,共获得102个等位基因,其中青头潜鸭,斑背潜鸭,红头潜鸭筛选出24个等位基因,凤头潜鸭筛选出30个等位基因,并对该四个物种的等位基因进行命名。通过碱基组成比例分析发现,青头潜鸭与斑背潜鸭碱基组成比例相似,红头潜鸭与凤头潜鸭相似。通过密码子使用偏倚性分析发现,在四种潜鸭外显子2中,使用频率较高的前三位是GAG（E）、GUG（V）和CAG（Q）。在外显子3中使用频率较高的前三位是GAG（E）、GAC（D）和GGG（G）或AAG（K）。选择压力分析得出与抗原结合的ABS区域受到正选择,非抗原结合的区域受到净化选择。通过PAML的M8模型检测出四个潜鸭物种外显子2和3受选择位点大多数都位于同抗原结合的ABS区域;通过外显子2和3构建的系统发育树均发现潜鸭物种MHC I类基因之间存在跨物种进化现象,同时在四种潜鸭的MHC I类等位基因中都检测到了重组信号和断点的位置。以上分析表明平衡选择与重组在维持四种潜鸭MHC Ⅰ类基因多样性中发挥着重要作用。
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