今年4月份,我省原第一人民医院院长一一王天朝涉嫌严重违纪,贪污受贿案曝光,他利用职工集资建房的名义,侵占房产100套、停车位100个,总价值约8000余万元。消息一出震惊全国,王天朝也被人们称为“双百院长”。从这一点反映出我省公立医院对基本建设项目投资的内部控制重视不足,内部控制制度存在诸多弊端,医院内部审计部门技术力量不足等问题,如何解决这些问题成为公立医院内部审计人员需要面对的难题。本文结合笔者从事医院基本建设项目投资审计的实务经验,介绍了我国公立医院工程建设行业基本情况,指出了内部控制视角下,公立医院基本建设存在的问题,进一步分析论述云南省某大型三甲医院一一F医院新区分院建设项目审计案例,详细的介绍了F医院新区分院建设项目管理、内部控制和审计实施情况,结合COSO内部控制五要素对项目管理进行内部控制评价,指出了审计发现的问题和弊端,最后提出了F医院审计部门应当从事后审计向工程建设初期的事情审计延生；将审计重点放在工程招投标、合同签订和造价控制环节等五条针对性建议,在本文的最后,作者指出了本文不足,希望后来的研究者继续完善。