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黑头酸臭蚁（Tapinoma melanocephalum）属于昆虫纲膜翅目（Hymenoptera）,蚁科（Formicidae）,臭蚁亚科（Dolichadernae）,是比较常见的家居和农林业害虫。黑头酸臭蚁原产于热带和亚热带地区,借助商业贸易等人为因素扩散至温带地区,对入侵地的生态系统、人类健康等构成威胁。本研究采用微卫星分子标记技术和线粒体COI基因序列分析（mt DNA COI）探究了中国华南地区6个黑头酸臭蚁大陆种群、5个岛屿种群及蚁群的遗传多样性,揭示了地理隔离对种群及蚁群的遗传多样性差异及遗传分化的影响,为进一步有效控制其危害提供了理论依据。主要研究结果如下:1筛选获得了10对微卫星引物本研究利用第二代测序技术中454GS FLX测序平台成功得到了黑头酸臭蚁的部分基因组信息。经过微卫星位点分离、引物多态性检测,得到了10对能稳定扩增且处于中高等多态性的微卫星引物,为黑头酸臭蚁的种群遗传多样性的研究提供了有效的工具。2比较研究了地理隔离对黑头酸臭蚁种群遗传多样性的影响采用上述10对中的6对多态性的引物（位点）对黑头酸臭蚁的不同地理种群的遗传多样进行分析。Hardy-Weinberg平衡检验结果显示,6个位点中有4个位点显著偏离平衡（P<0.05）。对6个位点进行无效等位基因检测发现,位点loci364具有较高的无效等位基频率。为了避免其对后续结果的评估造成影响,删掉该位点。5对微卫星位点标记11个黑头酸臭蚁种群中,共检测到128个等位基因,平均等位基因个数为25.600。各个位点等位基因丰富度（AR）范围在7.60014.664之间,平均表观杂合度（HO）和期望杂合度（HE）分别为0.460和0.663。对上述结果经t检验发现,黑头酸臭蚁大陆种群间的多样性和岛屿的相比没有显著性差异。在蚁群水平上,上川岛中各个蚁群的遗传多样性与其他地区的蚁群相比呈现出多样性水平低,但没有显著性差异。在种群水平上,除了山咀和北海两地种群外,上川岛种群的表观杂合度（HO）显著低于大陆部分地区即上川岛黑头酸臭蚁种群遗传多样性显著低于大陆部分地区种群的遗传多样性。基于线粒体COI基因序列对黑头酸臭蚁地理种群间的序列变异分析,结果显示序列片段长度为610bp,总共7个单倍型。大陆与岛屿种群均处于中低水平的遗传多样性,与利用微卫星标记各个地理种群的分析方法得到的结果相似。3比较研究了地理隔离对黑头酸臭蚁种群遗传结构的影响对黑头酸臭蚁种群进行贝叶斯聚类分析发现,大陆与岛屿的黑头酸臭蚁各个种群及蚁群有较高的混合比例,与地理分布没有相关性。种群遗传分化结果显示,有的岛屿与大陆种群之间的处于低等水平分化程度。除了山咀种群外,上川岛的种群与其他大陆和岛屿间种群有中高等遗传分化(FST>0.05)。Mantel检验发现各个大陆和岛屿的蚁群间的遗传距离与地理距离没有显著相关性。经分子方差分析（AMOVA）结果显示,黑头酸臭蚁的遗传变异来源于蚁群内个体间。对各个种群间所有个体进行相关性分析发现,上川岛不同蚁群的个体间相关性R值（识别度）相比其他蚁群高,并且种群遗传多样性低,与其他种群遗传分化程度高,这有利于其岛屿种群形成超级蚁群。BOTTLEN ECK分析显示,山咀、湛江、梅州、涠洲、东澳岛这几个种群在近期可能经历过瓶颈效应。对11个黑头酸臭蚁地理种群进行中性检验发现,总体分析Tajima’s D和Fu’s Fs的值分别为-0.0725和-0.250,结合整个种群单倍型错配分析发现,整个大陆和岛屿种群处于一个相对稳定发展状态。