作为中国资本市场重要组成要素的新三板市场,最初只是为承接和规范两网与退市公司而设立,但自其2013年12月开始接受挂牌申请至2017年12月,短短4年时间挂牌企业已经超过10000家,但随着新三板规模的不断扩张,挂牌公司在发展阶段、经营规模、盈利能力、股本以及估值方面都有很大的不同,公司质量的良莠不齐,伴随着也产生了一系列问题:市场流动性差,股票成交量低,投资者数量过少,信息披露监管的困难,财务舞弊事件频发。为此新三板市场宣布将挂牌企业划分成创新层与基础层两个部分,开启新三板分层管理时代,符合一定标准的较为成熟或者成长性较高的企业进入创新层,享受更多的政策红利,同时也接受更强有力的监督管理;另一部分暂时还未发展起来的企业留在基础层,在不被高质量企业淹没的情况下,寻求发展机会。但是引入的外来分层制度是否能够适应我国国情,新三板挂牌企业在分层制度的实施下财务绩效有何变化?本文便以综合绩效得分的方式将结果直接的展现出来。本文从选题的背景意义出发,梳理国内外学者对分层管理与企业绩效评价方面的文献,总结出新三板市场及其分层管理办法的发展概况,以财务绩效评价理论为基础,构建指标体系,运用因子分析法来实现对新三板挂牌企业财务绩效进行评价的目的。通过数据的分析,主要得出以下结论:(1)从总体来看,无论是创新层企业还是基础层企业,超过样本总量半数以上的企业经济效益都有了一定的提升,而且基础层企业数量多于创新层企业数量。(2)在2015-2016年间,创新层势头较猛,发展较快,但在2016-2017年间,分层制度实施之后,两个层级的企业财务绩效上升的速度都有所下降,但是仍然超过半数以上企业财务绩效提升,而且基础层企业的发展速度也有迎头赶上的趋势。(3)上升行业中以医药制造业势头最猛,软件与信息技术服务业次之,都是高科技高投入的行业,利用新三板分层后良好的融资环境得到了迅猛的发展。当然,分层制度也不是一劳永逸的,本文最后也针对一些可改进的地方,分政府、企业、投资者三大角度提出了自己的建议。