科学技术与创新一直是推动生产力的重要手段，在历史上深深地影响和决定着人类的文明进程，到了二十一世纪的今天，世界各国尤其是发达国家早已将创新纳入国家战略，创新成为各国占据新时代制高点的法宝。同时，随着全球化浪潮来袭，人们的地理区域距离逐渐被淡化，但各地经济、科技的区域性特点反而随着集聚效应而不断增强，于是区域创新系统引起了各国学者的普遍重视和广泛研究。　　区域创新系统是一个复杂的综合系统，从创新的数量和质量上对创新进行把握，可以将区域创新系统划分成区域创新能力子系统和区域创新绩效子系统，两者若协调稳固发展则能产生巨大的经济效益，若两者失衡发展，则可能不但不会成为经济增长的牵引力，还可能制肘其发展，所以需要对区域创新能力和区域创新绩效子系统发展水平进行测度，对两者进行协调性分析评判。　　本文将区域创新能力水平归结为区域投入能力、区域创新产出能力、区域创新运行能力、区域创新转化能力和区域创新环境支撑力五种能力之间相互运行的结果，其综合体现着创新发展的“数量”或“规模”；而从投入与产出的角度把区域创新绩效示为区域创新系统的“质量”或“结构”。结合数据挖掘中的粗糙集和模糊集的相关方法运用实证研究，对我国对各地区域创新能力和绩效子系统发展水平及其协调性进行测度，掌握各地区域创新系统发展的现状，为各地产业结构的合理优化和资源的高效配置提供参考性建议。