平潭综合实验区因台而设、为台而兴，肩负着探索深化改革开放、推进祖国和平统一和实现两岸融合发展新模式的重要使命，其先行先试之路径选择和实践成败，事关我国科学发展、改革开放、和平统一道路的最终取向。平潭最为引人瞩目的是“五个共同”模式，其中尤以“共同管理”最为核心，也最为复杂，这是在两岸不同制度、不同体制下探索融合发展面临的最大挑战。尽管国家赋予平潭比经济特区还特的扶持政策，福建也举全省之力以“一天两个亿”、“二十年再造一个厦门”的大手笔超常规推进，但是，两岸“共同管理”平潭并没有得到实质性的全方位推进，尚处于大陆单方主导阶段，主要原因有政治合作敏感、台湾当局抵制、两岸制度差异、台湾主体缺位等。因此，亟需两岸政府从战略全局高度开展系统的顶层设计予以超前引领，从而把推动两岸“共同管理”平潭的动力源从民间底层推动转向政府顶层拉动、把动力方向从大陆单方推动转向两岸双向互动。通过在平潭先行先试的深度“共管”实践，推动两岸早日实现全面共建共管“共同家园”，积极为实现祖国和平统一、促进两岸融合发展探索途径、提升互信、积累经验、提供示范。通过研究，结果表明：（1）顶层设计两岸“共同管理”平潭，不仅必要、而且可行，两岸政府应积极开展政治对话互动，多方协调，加快推进；（2）顶层设计两岸“共同管理”平潭，重点是制度创新设计与对接融合，关键是用足用好国家赋予的先行先试政策，在政治对话、制度融合、法律对接、模式创新、环境建设等重点领域和关键环节取得实质性突破；（3）根据两岸关系发展现状和两岸“共同管理”平潭现实推进情况，两岸“共同管理”平潭应分阶段推进，并以“多层治理”模式实践“共同管理”；（4）开放包容的平潭，是两岸的平潭，也是世界的平潭，应系统地开展全方位的全球营销，广泛凝聚全球正能量，既引资引技引智，又塑造平潭良好国际形象。